| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 891,856 | +AC :: IS30 (–) | coding (673/723 nt) | nfsA → | NADPH‑dependent nitro/quinone reductase NfsA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 891856 | 0 (0.000) | 99 (1.060) | 71/598 | 0.1 | 100% | coding (673/723 nt) | nfsA | NADPH‑dependent nitro/quinone reductase NfsA |
| ? | NC_000913 | 4507457 = | NA (NA) | noncoding (333/334 nt) | IS911 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | 891857 = | 0 (0.000) | 91 (0.980) | 62/598 | 0.3 | 100% | coding (674/723 nt) | nfsA | NADPH‑dependent nitro/quinone reductase NfsA |
| ? | NC_000913 | 1469296 = | NA (NA) | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
CGGCGGCCTGCGCAATAATATTGAAGCGGTGACGAAACTGCTTAAATTACCGCAGCATGTTCTGCCGCTGTTTGGGCTGTGCCTTGGCTGGCCTGCGGATAATCCGGATCTTAAGCCGCGTTTACCGGCCTCCATTTTGGTGCATGAAAACAGCTATCAACCGCTGGATAAAGGCGCACTGGCGCAGTATGACGAGCAACTGGCGGAATATTACCTCACCCGTGGCAGCAATAATCGCCGGGATACCTGGAGCGATCATATCCGCCGAACAATCATTAAAGAAAGCCGCCCATTTATTCTGGATTATTTGCACAAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCC > NC_000913/891570‑892153 | cattttggctgacaaaccagctcgtatctcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctaattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaGCACATTTATTCt < 2:609639‑M1/13‑1 (MQ=255) tcgtatctcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctaattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaGCCCATTTATTCTGGAttatttgcacacccaggg < 1:32594‑M1/34‑8 (MQ=255) cgtatctcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaGCCCATTTATTCTGGATTATTTGCACAAACAGGGt < 1:309766‑M1/35‑1 (MQ=255) ctcctcgcgctcagacagtgtcaggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaGCCCATTTATTCTGGATTATTTGCACAAACAGGGTTGGGc > 1:751529‑M1/261‑300 (MQ=255) 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caggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgntcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaGCCCATTTATTCTGGATTATTTGCACAAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGt < 2:98962‑M1/61‑1 (MQ=255) caggtgagctacagcccgcttacgctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgntcgtctaattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaGCCCATTTATTCTGGATTATTTGCACAAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGt < 2:99080‑M1/61‑1 (MQ=255) agctacagcccgcttacgctcatggggttttntgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcaatgaagcctgttccgttcttccatngttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaGCCCATTTATTCTGGATTATTTGCACAAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGt < 2:640274‑M1/67‑1 (MQ=255) 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ctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactnttgcgttgaccaattgaatctacaGCCCATTTATTCTGGATTATTTGCACAAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTg < 1:281358‑M1/85‑1 (MQ=255) ctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactnttgcgttgaccaattgaatctacaGCCCATTTATTCTGGATTATTTGCACAAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGAGGGCTTTTg < 1:281136‑M1/85‑1 (MQ=255) ctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaGCCCATTTATTCTGGATTATTTGCACAAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTg < 1:105333‑M1/85‑1 (MQ=255) ctcatggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaGCCCATTTATTCTGGATTATTTGCACAAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTg < 2:725900‑M1/85‑1 (MQ=255) catggggttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaGCCCATTTATTCTGGATTATTTGCACAAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGAc > 1:406969‑M1/214‑300 (MQ=255) gttttatgccgccagtatcccttaacatagtgaagatcgttccgggttttgaacccaggatattcgctatttcactgaagcctgttccgttcttccatagttcaaaaacagaggctttttcctctgctgtaaatgttcgtctcattcaaaaaacctccgcaaccccatgttttcacataactgttgcgttgaccaattgaatctacaGCCCATTTATTCTGGATTATTTGCACAACCAGGGTTGGGCGACGCGCTAACACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTc < 1:700940‑M1/93‑1 (MQ=255) 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CGGCGGCCTGCGCAATAATATTGAAGCGGTGACGAAACTGCTTAAATTACCGCAGCATGTTCTGCCGCTGTTTGGGCTGTGCCTTGGCTGGCCTGCGGATAATCCGGATCTTAAGCCGCGTTTACCGGCCTCCATTTTGGTGCATGAAAACAGCTATCAACCGCTGGATAAAGGCGCACTGGCGCAGTATGACGAGCAACTGGCGGAATATTACCTCACCCGTGGCAGCAATAATCGCCGGGATACCTGGAGCGATCATATCCGCCGAACAATCATTAAAGAAAGCCGCCCATTTATTCTGGATTATTTGCACAAACAGGGTTGGGCGACGCGCTAAAACCGCCACGTCGATGTATGATACGCGGGCTTTTGACCAGGTCTGACAGAGAGGTGCAGGGTGAAAATTGCCATATTGTCCCGGGATGGAACGCTCTATTCGTGTAAGCGGCTGCGTGAAGCCGCTATACAGCGCGGTCACCTGGTTGAAATTCTTGATCCGCTTTCTTGCTACATGAACATAAATCCTGCGGCGTCTTCTATTCACTACAAAGGCCGCAAGTTACCCCATTTTGACGCAGTGATCC > NC_000913/891570‑892153 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |