| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 1,589,920 | Δ647 bp | [ydeT] | [ydeT] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 1589920 | 1590566 | 647 | 110 [0] | [1] 112 | [ydeT] | [ydeT] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1589919 | 0 (0.000) | 110 (1.190) | 74/594 | 0.1 | 100% | coding (83/1149 nt) | ydeT | fimbrial usher domain‑containing protein YdeT |
| ? | NC_000913 | 1590567 = | 0 (0.000) | intergenic (‑566/+287) | ydeT/hipA | fimbrial usher domain‑containing protein YdeT/serine/threonine‑protein kinase toxin HipA | |||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
ATACTGTAACTGGCGTTTGAATTACGAAATGCCGACTGACTGTCTGTACGCATCCAATGACTGAAGGGAACATTAAGCGTAAAAGCGAGTAAATGATCCCGATCGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTCGTAATATCACCAAACGGCACATTTAATCCAAATGATATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTGTTCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1589622‑1589919‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATGATTTAACATAATATACATTATGCGCACCAATATAAACCAAGGAAGAATCCAGTCGTTGGCGGTCATGATTGTCATGCTCATTAACAATGACCAAACCCCATATCTCACTTACT > NC_000913/1590567‑1590862 ATACTGTAACTGGCGTTTGAATTACGAAATGCCGACTGACTGTCTGTACGCATCCAATGACTGAAGGGAACATTAAGCGTAAAAGCGAGTAAATGATCCCGATCGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTCGTAATATCACCAAACGGCACATTTAATCCAAATGATATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTGTTCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGATAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTACAG < 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AGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCNATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATGATTTAACATAATATACATTATGCGCACCAATATAAACCAAGGAAGAATCCAGTCGTTGGCGGTCATGATTGTCATGCTCATTAACAA < 1:294007/300‑1 ATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCCTACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGNCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATGATTTAACATAATATACATTATGCGCACCAATATAAACCAAGGAAGAATCCAGTCGTTGGCGGTCATGATTGTCATGCTCATTAACAATG < 2:366100/300‑1 TGACCACGCTTACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCTACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTCCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAATAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCATAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATGATTTAACATAATATACATTATGCGCACCAATATAAACCAAGGAAGAATCCAGTCGTTGGCGGTCATGATTGTCATGCTCATTAACAATGACCAAACCCCATATC < 2:492076/300‑1 TGACCACGCTTACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGTGCAGGGAATAACCATGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGTAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATGATTTAACATAATATACATTATGCGCACCAATATAAACCAAGTAAGAATCCAGTCGTTGGCGGTCATGATTGTCATGCTCATTAACAATGACCAAACCCCATATC < 2:31457/300‑1 TGACCACGCTTACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGNCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATGATTTAACATAATATACATTATGCGCACCAATATAAACCAAGGAAGAATCCAGTCGTTGGCGGTCATGATTGTCATGCTCATTAACAATGACCAAACCCCATATC < 1:301832/300‑1 CGCTTACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATGATTTAACATAATATACATTATGCGCACCAATATAAACCAAGGAAGAATCCAGTCGTTGGCGGTCGTGATTGTCATGCTTATTAACAATGACCAAACCCCATATCTAACTT > 2:423666/1‑300 CGCTTACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATGATTTAACATAATATACATTATGCGCACCAATATAAACCAAGGAAGAATCCAGTCGTTGGCGGTCATGATTGTCATGCTCATTAACAATGACCAAACCACATATCTCACTT > 1:223166/1‑300 CGCTTACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATGATTTAACATAATATACATTATGCGCACCAATATAAACCAAGGAAGAATCCAGTCGNTGGCGGTCATGGTTGTCATGCTCATTAACACTGACCAAAACCAATATCTaaatt > 2:647673/1‑295 TTACAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATGATTTAACATAATATACATTATGCGCACCAATATAAACCAAGGAAGAATCCAGTCGTTGGCGGTCATGATTGTCATGCTCATTAACAATGACCAAACCCCATATCTCACTTACT < 2:699153/300‑1 ATACTGTAACTGGCGTTTGAATTACGAAATGCCGACTGACTGTCTGTACGCATCCAATGACTGAAGGGAACATTAAGCGTAAAAGCGAGTAAATGATCCCGATCGTTTTGCCATATATTATTGGAATAGCTGTAATTCAGCGAAGTCGTAATATCACCAAACGGCACATTTAATCCAAATGATATTTGCTGGTCGCTGCGTGACGTGTTCCAGTAACTTTGGCGACTGGCACTGAAAAATGTCGTACCGTAATTTCCAAGCTGCTGAGAGATGCTTATTTGTTCCTGACCACGCTTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1589622‑1589919‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acAGCACCCTCTGGTGTTTTCGTATGCAGTGTCTATGCGACAGACACTGCGCTCTTAGCATGGGGCAGGGAATAACCAGGCTATTTCTCCATGCACAGGCCAATTATGAAAGAGGAGAGGCTTAAGTTCTTGAACCCTGAACGAATAACGACTACCAGAAAAGCACTTCGCATCACTCAGACATGATTTAACATAATATACATTATGCGCACCAATATAAACCAAGGAAGAATCCAGTCGTTGGCGGTCATGATTGTCATGCTCATTAACAATGACCAAACCCCATATCTCACTTACT > NC_000913/1590567‑1590862 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |