New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 315229 = | NA (NA) | 100 (1.080) +T |
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GCTGGGTAAGATCATGGTTCCATTGCCGAGCGTTCATTACAGGATATTAATGCCGATTTAATGTTTGTCGGTGCTGATGGTATTGATGCGGTTAATGGTATTACGACCTTTAATGAAGGTTATTCTATTAGCGGTGCGATGGTCACAGCCGCTAATAAAGTGATTGCCGTTCTCGATTCATCGAAATTTAACCGTCGCGGTTTTAATCAGGTACTACCAATCGAAAAAATTGACATTATTATTACCGATGATGCTGTGTCAGAGGTGGATAAACTGGCATTGCAGAAGACGCGGGTAAAA < 1:102452/300‑1 GGGTAAGATCATGGTTCCATTGCCGAGCGTTCATTACAGGATATTAATGCCGATTTAATGTTTGTCGGTGCTGATGGTATTGATGCGGTTAATGGTATTACGACCTTTAATGAAGGTTATTCTATTAGCGGTGCGATGGTCACAGCCGCTAATAAAGTGATTGCCGTTCTCGATTCATCGAAATTTAACCGTCGCGGTTTTAATCAGGTACTACCAATCGAAAAAATTGACATTATTATTACCGATGATGCTGTGTCAGAGGTGGATAAACTGGCATTGCAGAAGACGCGGGTAAAATTA > 1:32918/1‑300 GATCATGGTTCCATTGCCGAGCGTTCATTACAGGATATTAATGCCGATTTAATGTTTGTCGGTGCTGATGGTATTGATGCGGTTAATGGTATTACGACCTTTAATGAAGGTTATTCTATTAGCGGTGCGATGGTCACAGCCGCTAATAAAGTGATTGCCGTTCTCGATTCATCGAAATTTAACCGTCGCGGTTTTAATCAGGTACTAACAATCGAAAAAATTGACATTATTATTACCGATGATGCTGTGTCAGAGGTGGATAAACTGGCATTGCAGAAGACGCGGGTAAAATTAATTACG > 1:548266/1‑300 | CAGCTGGCGTTTGAGACGTGCAATCTCGGTAGACATCTCCAGTTCACGTTCAGAAGACGTCTGCTGATTTTGCTGTTTACTGCGCCAGTTGTAGAGTTGTGATTCATACAGGCTGAGTTCACGGGCTGCGGCAGTAACACCGATGCGTTCAGCAAGCTTCAGGGCTTCACTGCGAAATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/315521‑315229 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CATGGTTCCATTGCCGAGCGTTCATTACAGGATATTAATGCCGATTTAATGTTTGTCGGTGCTGATGGTATTGATGCGGTTAATGGTATTACGACCTTTAATGAAGGTTATTCTATTAGCGGTGCGATGGTCACAGCCGCTAATAAAGTGATTGCCGTTCTCGATTCATCGAAATTTAACCGTCGCGGTTTTAATCAGGTACTACCAATCGAAAAAATTGACATTATTATTACCGATGATGCTGTGTCAGAGGTGGATAAACTGGCATTGCAGAAGACGCGGGTAAAATTAATTACG < NC_000913/2169995‑2169699 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |