| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 280111 | NA (NA) | 14 (0.150) | 10/594 | 6.4 | 9.9% | noncoding (181/181 nt) | IS30 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 889531 | 127 (1.370) | coding (289/1686 nt) | ybjL | putative transport protein YbjL | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AATTCGGCAGTACTTTCCTAAAAAGACATGTCTTGCCCAATATACTCAACATGAACTAGATCTGGTTGCTGCTCAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/279948‑280111‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caCTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGACCAGCGCCC < NC_000913/889531‑889240 AATTCGGCAGTACTTTCCTAAAAAGACATGTCTTGCCCAATATACTCAACATGAACTAGATCTGGTTGCTGCTCAGCTAAACAACAGACCTAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAATAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACAC < 1:469712/300‑1AATTCGGCAGTACTTTCCTAAAAAGACATGTCTTGCCCAATATACTCAACATGAACTAGATCTGGTTGCTGCTCAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACAC < 1:203321/300‑1AATTCGGCAGTACTTTCCGAAAAAGACATGTCTTGCTCAATATACTCAACATGAACTAGATCTGGTTGCTGCTCGGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACCGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGGCAGATTGAATCTGCACTGTTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGATGTCGACACTGGTTCTGGTCGGTGCTGTCGATACAC < 2:577845/300‑1 GAACTAGATCTGGTTGTTGCTCAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACAACGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAGGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGCCTGCCGGTATGTTAGCAGACTCTATGACGTCGCCCCCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCT > 2:688074/1‑300 CTGCTCAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGGTGATGGTTGNCAGTGCGCTGGTGATAGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCC < 1:295015/300‑1 AGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAATAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACC < 1:328633/300‑1 AAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAAGGGTGTTGCATTGACAGGTTGAATCCACACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATATTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTTTGGTCAGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCACGGAAAGCAGGCAGCTCTAACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATT > 2:26423/1‑300 ACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTT < 1:750948/300‑1 ACAGATTGAATCTACACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGAC < 2:682464/300‑1 GATTGAATCTACACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCANTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGACCAG > 1:643591/1‑300 GATTGAATCTACACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGACCAG > 1:271770/1‑300 TGAATCTACACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGACCAGCGC < 1:314811/300‑1 AATCTACACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGACCAGCGCCC > 1:748718/1‑300 AATCTACACTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGATGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTAGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGCTTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGACCAGCGCCC > 2:436299/1‑300 AATTCGGCAGTACTTTCCTAAAAAGACATGTCTTGCCCAATATACTCAACATGAACTAGATCTGGTTGCTGCTCAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/279948‑280111‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caCTGGTGATGGTTGGCAGTGCGCTGGTGATCGCCTTAGGGTTAGGTAAGCTGTTTGGCTGGGATATTGGCCTGACGGCCGGTATGTTAGCAGGCTCTATGACGTCGACACCGGTTCTGGTCGGTGCTGGCGATACACTGCGTCATTCCGGCATGGAAAGCAGGCAGCTCTCACTGGCACTGGATAATCTGAGCCTCGGGTATGCCTTAACCTATTTAATCGGTCTGGTGAGTTTGATTGTTGGTGCGCGTTACTTGCCGAAATTGCAGCATCAGGACTTACAGACCAGCGCCC < NC_000913/889531‑889240 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |