Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,436,956 | 2 bp→TT | coding (202‑203/741 nt) | cysQ → | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,436,956 | 0 | C | T | 100.0% | 281.3 / NA | 79 | P68F (CCC→TTC) | cysQ | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (31/48); total (31/48) | |||||||||||
* | NC_000913 | 4,436,957 | 0 | C | T | 98.7% | 282.2 / NA | 79 | P68F (CCC→TTC) | cysQ | 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (31/47); minor base G (0/1); total (31/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TGATGACACTATCACAGTTGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACAGAGACGAGGTGGAGAAATGTTAGATCAAGTATGCCAGCTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTCCCGGTTGGGAAGTCCGTCAGCACTGGCAGCGTTACTGGCTGGTAGACCCGCTGGATGGTACTAAAGAGTTTATTAAACGTAATGGCGAATTCACCGTTAACATTGCGCTCATTGACCATGGCAAACCGATTTTAGGCGTGGTGTATGCGCCGGTAATGAACGTAATGTACAGCGCGGCAGAAGGCAAAGCGTGGAAAGAAGAGTGCGGTGTGCGCAAGCAGATTCAGGTCCGCGATGCGCGCCCGCCGCTGGTGGTGATCAGCCGTTCCCATGCGGATGCGGAGC > NC_000913/4436665‑4437241 || tgatgaCACTATCACAGTTGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACAGAGACGAGGTGGAGAAATGTTAGATCAAGTATGCCAGCTTGCACGGAATGCAGGCGATGCCATTATGCAGGTCTACGACGGGACGAAACCGATGGACGTCGTCAGCAAAGCGGACAATTCTCCGGTAACGGCAGCGGATATTGCCGCTCACACCGTTATCATGGACGGTTTACGTACGCTGACACCGGATGTTCCGGTCCTTTCTGAAGAAGATCCTTTCGGTTgg > 1:831315/1‑300 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |