| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,861,422 | G→A | intergenic (‑188/‑8) | ygbI ← / → ygbJ | DNA‑binding transcriptional repressor YgbI/putative L‑threonate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,861,422 | 0 | G | A | 99.0% | 346.1 / ‑5.7 | 100 | intergenic (‑188/‑8) | ygbI/ygbJ | DNA‑binding transcriptional repressor YgbI/putative L‑threonate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (35/64); total (36/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
GGTCATATGTGACACATTCATTCTGTCCGTTAGTTCAGCAATACTGACAATGCCTTTTTCAGCTACCATCTCAAGGATGATTTGGCGACGCTCTACGGGTATCAACTTTTGCTCCTTCCTTTGTCCTGCTGACATTCTACGCTATTTGCCTGCGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCATGTCGGTATCGTTGGCTTAGGGTCAATGGGAATGGGAGCAGCACTGTCATATGTCCGCGCAGGTCTTTCTACCTGGGGCGCAGACCTGAACAGCAATGCCTGCGCTACGTTGAAAGAGGCAGGTGCTTGCGGGGTTTCTGATAACGCCGCGACGTTTGCCGAAAAACTGGACGCACTGCTGGTGCTGGTGGTCAATGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGG > NC_000913/2861130‑2861715 | ggTCATATGTTACACATTCATTCTGTCCGTTAGTTCAGCAATACTGACAATGCCTTTTTCAGCTACCATCTCAAGGATGATTTGTCGACGCTCTACGGGTATCAACTTTTGCTCCTTCCTTTGTCCTGCTGACATTCTACGCTATTTGCCTGCGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGAAGAGCAg < 2:441146/300‑1 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GGTCATATGTGACACATTCATTCTGTCCGTTAGTTCAGCAATACTGACAATGCCTTTTTCAGCTACCATCTCAAGGATGATTTGGCGACGCTCTACGGGTATCAACTTTTGCTCCTTCCTTTGTCCTGCTGACATTCTACGCTATTTGCCTGCGAAACGTGCGCGGCGCAACTAACGCTTAGTTCACATAAAATAACACACAATGTTAATTTATGTGAATCAGATCACCATACCGTTATCTTCCAGCGCTTATATTCACAATATCAAACAAAATATCACTTAAATTAACAAGGAGAGCAGATGAAAACGGGATCTGAGTTTCATGTCGGTATCGTTGGCTTAGGGTCAATGGGAATGGGAGCAGCACTGTCATATGTCCGCGCAGGTCTTTCTACCTGGGGCGCAGACCTGAACAGCAATGCCTGCGCTACGTTGAAAGAGGCAGGTGCTTGCGGGGTTTCTGATAACGCCGCGACGTTTGCCGAAAAACTGGACGCACTGCTGGTGCTGGTGGTCAATGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGG > NC_000913/2861130‑2861715 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |