| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,773,724 | G→A | G136E (GGG→GAG) | yfjW → | uncharacterized protein YfjW |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,773,724 | 0 | G | A | 99.2% | 435.5 / NA | 121 | G136E (GGG→GAG) | yfjW | uncharacterized protein YfjW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (63/57); minor base C (1/0); total (64/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
GGCGTTCTCTTTCAATATTTTACCGCTGCCTTCACAAAAGGTAATTGTTATGAATGCTCAATGAAACTTGATTACATAAAACAATTTTATTTTTCACTGGAAACCGCATGGTACCTCATATCTGCTGTTGCAGTATTTATTGCATCTGTTTTTATACAGCATAGAATTAAAGCTTATTTAACATTATTAGCTATTACATGGATTGTACTAACAATAACAGATGTGGCGTTAATACACGCCTTAGACAATATAGCCATGAATAATATTTTGTTAAATATACTATATAATCTTTTTGGGGCGATTTTATTGTCACTGTTTATGTGTTTATCAAATTCCCTCCTTTTCCACCTTAATAAGATAAAACATATTCCAATGATTTTATCGGCAATGATTCCATTAGTTTCCGCAATAATAATAGCCATACTCATAACCGCTGTTATATATTTATTGTTTGCCCGGCAGGCGGTAGAGATTGAGATGGATATATCTGAAGGTTCAGACATCGCATATGTAGGTGTAAAAGATAATGAGGAATCATTTGGGTTTTTAAATGATAAAAAAACAGACACACCAACGTATCTGGAT > NC_000913/2773429‑2774013 | tttCAATATTTTACCGCTGCCTTCACAAAAGGTAATTGTTATGAATGCTCAATGAAACTTGATTACATAAAACAATTTTATTTTTCACTGGAAACCGCATGGTACCTCATATCTGCTGTTGCAGTATTTATTGCATCTGTTTTTATACAGCATAGAATTAAAGCTTATTTAACATTATTAGCTATTACATGGATTGTACTAACAATAACAGATGTGGCGTTAATACACGCCTTAGACAATATAGCCATGAATAATATTTTGTTAAATATACTATATAATCTTTTTGAGGCGATTTTATTg < 1:111309/300‑1 (MQ=255) 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GGCGTTCTCTTTCAATATTTTACCGCTGCCTTCACAAAAGGTAATTGTTATGAATGCTCAATGAAACTTGATTACATAAAACAATTTTATTTTTCACTGGAAACCGCATGGTACCTCATATCTGCTGTTGCAGTATTTATTGCATCTGTTTTTATACAGCATAGAATTAAAGCTTATTTAACATTATTAGCTATTACATGGATTGTACTAACAATAACAGATGTGGCGTTAATACACGCCTTAGACAATATAGCCATGAATAATATTTTGTTAAATATACTATATAATCTTTTTGGGGCGATTTTATTGTCACTGTTTATGTGTTTATCAAATTCCCTCCTTTTCCACCTTAATAAGATAAAACATATTCCAATGATTTTATCGGCAATGATTCCATTAGTTTCCGCAATAATAATAGCCATACTCATAACCGCTGTTATATATTTATTGTTTGCCCGGCAGGCGGTAGAGATTGAGATGGATATATCTGAAGGTTCAGACATCGCATATGTAGGTGTAAAAGATAATGAGGAATCATTTGGGTTTTTAAATGATAAAAAAACAGACACACCAACGTATCTGGAT > NC_000913/2773429‑2774013 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |