| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 2,258,149 | T→G | K73N (AAA→AAC) | psuG ← | pseudouridine‑5'‑phosphate glycosidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,258,149 | 0 | T | G | 99.2% | 476.6 / NA | 128 | K73N (AAA→AAC) | psuG | pseudouridine‑5'‑phosphate glycosidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base G (66/60); minor base A (0/1); total (66/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.80e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
CCTAAATCGAGAATAGATTTCGCCCCGGCACAAACAACGGTGACATTAGTATTTGCCAGTTCTTGCAAATCGGCAGAAATATCGAAGGTATGTTCCGCCCCGCGATGCACACCACCAATTCCCCCGGTGGCAAATACTTTAATTCCGGCAAGCGCCGCAATAATCATCGTTGAAGCCACAGTGGTTGCGCCATTTTTTCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCACGACCCAGTAATTCAATTTCTTCTTTGCTTAACCCCACTTTCATCACGCCGCCAATAATGGCGATCGTGGCAGGTACAGCGCCCTGTTTACGAATAGTTTCTTCAACTTCAATTGCGGTCTGGGCATTTTGTGGGAACGGCATCCCGTGAGAAATAATGGTCGATTCCAGCGCCACAACCGGTTTTTTGTTTTTTAAAGCGTCCTGCACTTCCGGGGAAATTTGTAATAATTCAGGGGAAATTTTTAATTCAGACATTCTGCGTTCTCCACTAACGATATAACGTTGGCAATCGATAAATCGGGGTTATTGGTGTATTCACAGGAGAGCGCC > NC_000913/2257853‑2258442 | ccTAAATCGAGAATAGATTTCGCCCCGGCACAAACAACGGTGACATTAGTATTTGCCAGTTCTTGCAAATCGGCAGAAATATCGAAGGTATGTTCCGCCCCGCGATGCACACCACCAATTCCCCCGGTGGCAAATACTTTAATTCCGGCAAGCGCCGCAATAATCATCGTTGAAGCCACAGTGGTTGCGCCATTTTTTCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTACCTTTGGTCACGTTATGCCCTTCACGACCCAGTAATTCAATTTCTTCTTTGCTTAACCCCACGTtc > 2:340877/1‑300 (MQ=255) 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ttGCTTAACCCCACGTTCATCACCCCGCCAATAATGGCGATCTTGGCAGTTACAGCGCCCTGTTTACGAATAGTTTCTTCAACTTCAATTGCGGTCTGGGCATTTTGTGGGAACGGCATCCCGTGAGAAATAATGGTCGATTCCAGCGCCACAACCGGTTTTTTGTTTTTTAAAGCGTCCTGCACTTCCGGGGAAATTTGTAATAATTCAGGGGAAATTTTTAATTCAGACATTCTGCGTTCTCCACTAACGATATAACGTTGGCAATCGATAAATCGGGGTTATTGGTGTATTCACAgg < 2:84926/300‑1 (MQ=255) ttGCTGAACCCCACGTTCATCACGCCGCCAATAATGGCGATCTTGGCAGGTACAGCGCCCTGTTTACGAATAGTTTCTTCAACTTCAATTGCGGTCTGGGCATTTTGTGGGAACGGCATCCCGTGAGAAATAATGGTCGATTCCAGCGCCACAACCGGTTTTTTGTTTTTTAAAGCGTCCTGCACTTCCGGGGAAATTTGTAATAATTCAGGGGAAATTTTTAATTCAGACATTCTGCGTTCTCCACTAACGATATAACGTTGGCAATCGATAAATCGGGGTTATTGGTGTATTCACAgg < 1:46739/300‑1 (MQ=255) gCTTAACCCCACGTTCATCACGCCGCCAATAATGGCGATCGTGGCAGGTACAGCGCCCTGTTTACGAATAGTTTCTTCAACTTCAATTGCGGTCTGGGCATTTTGTGGGAACGGCATCCCGTGAGAAATAATGGTCGATTCCAGCGCCACAACCGGTTTTTTGTTTTTTAAAGCGTCCTGCACTTCCGGGGAAATTTGTAATAATTCAGGGGAAATTTTTAATTCAGACATTCTGCGTTCTCCACTAACGATATAACGTTGGCAATCGATAAATCGGGGTTATTGGTGTATTCACAGgag > 1:395460/1‑300 (MQ=255) 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CCTAAATCGAGAATAGATTTCGCCCCGGCACAAACAACGGTGACATTAGTATTTGCCAGTTCTTGCAAATCGGCAGAAATATCGAAGGTATGTTCCGCCCCGCGATGCACACCACCAATTCCCCCGGTGGCAAATACTTTAATTCCGGCAAGCGCCGCAATAATCATCGTTGAAGCCACAGTGGTTGCGCCATTTTTTCCGGCGGCAACAACAAAAGGTAAATCGCGACGACTAACTTTGGTCACGTTATGCCCTTCACGACCCAGTAATTCAATTTCTTCTTTGCTTAACCCCACTTTCATCACGCCGCCAATAATGGCGATCGTGGCAGGTACAGCGCCCTGTTTACGAATAGTTTCTTCAACTTCAATTGCGGTCTGGGCATTTTGTGGGAACGGCATCCCGTGAGAAATAATGGTCGATTCCAGCGCCACAACCGGTTTTTTGTTTTTTAAAGCGTCCTGCACTTCCGGGGAAATTTGTAATAATTCAGGGGAAATTTTTAATTCAGACATTCTGCGTTCTCCACTAACGATATAACGTTGGCAATCGATAAATCGGGGTTATTGGTGTATTCACAGGAGAGCGCC > NC_000913/2257853‑2258442 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |