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ttCAGAAAAAATCGAACTTGATGGGAAAGCTGTGATAAGCGGAGTCTACTTGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTCACCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACGGTATTATTc < 1:691021/300‑1 (MQ=255) aaaaaaTCGAACTTGATGGGAAAGCtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgatagtcttaatactagtttttagactagtcattggagaacagatgattgatgtcttagggccggagaaacgcagacggcgtaccacacaggaaaagatcgcaattgttcagcagagctttgaaccggggatgacggtctccctcgttgcccggcaacatggtgtagcagccagccagttatttctctggcgtaagcaataccaggaaggaagtcttactgctgtcg > 1:729616‑M2/1‑25 (MQ=255) tccaAAAGCTGTGATAAGCGTAGTCTACTTGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTCACCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACGGTATTATTCATCTGGTCGATAGCGCCcgga > 2:340079‑M2/5‑300 (MQ=255) | ATATCGGTAGTTATGCCGTGTTAATTGATAGCAACAACATTAGTGCCAGCAATGGTAGCCAGACGTTAGCTGTATCAATAGCAGGTGCAGATGCCGTCATAACAGGGCAAAAAAGAGCATGGCAAACGCTCACCGCTTATCCGCTTGCAGTCGATCAAAGCTATTATTACACCTTTGTAAAACCAGGTGAAACAACCCCAACTCCTGTAACGAACGCCATTATACCGCTTCAGGTGA‑GCGCATCTATCGCGAATGATTTAGGCGGTTCAGAAAAAATCGAACTTGATGGGAAAGCTGTGATAAGCGTAGTCTACTTGTGATAACAATGCCGGACAGGAGTACTATCAGGCATTCGTTTTATACGATCGGTTAATGTTTCAGGAAAGCTCTTCGCATATCTTGGGGAAAGTAAATGTAATACGCTGTTCTTAATTGTTCAGTGCTCACCCCCCAGAGTATAGCTCATTCCATTATTCAACTTAGCTCCATATAAAGGGACAGATAATGGAATCGCTCTCAGAAGGAACCACAGCAGGCTACCAGCAAATCCACGACGGTATTATTCATCTGGTCGATAGCGCCCGGA > NC_000913/3367323‑3367908 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |