| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 1578041 | 106 (1.040) | coding (1302/1686 nt) | yddA | ABC transporter family protein YddA | |||||
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
GTAGTTTTTCACGCACTAAACGCAGTAAGCGGATAGCCTCTTGTTCCTCAAGATGAGAGGTAGTTTCGTCAAGAAATATCCATTTCGGACGTCGTAAAATTAATCGTGCCAGGGCGATACGTTGTTTTTCGCCGCTGGAAAGAATATCTCCCCAGCGATCGTGGTCATGAATACGCGCAGCCAATTTCCCAAGACCAACCTGATGCAGTACTTCGCTCAACGATTTATCGTCTACGGGCAGGGGAAGTGCTTTACAAATAATCTCTTTCAGTAAGCCGGTTTTGATTAACGGTGTTTGTGACACATACCAACTGTCAGCAGGAGAAGAAATATCACCTTTAAACCACGGCCAGCAGTGGGATAATGTTTTAAGCAGTGTGGTTTTTCCCGCGCCAGAGTAGCCTTTCAGTAATAGCCATTTGCCTGGCGAAACATGAAAGTTCAGGTTCTCTAATATGATCTTATTATCAGGCGTACGAATACTCGCATCAGCCACTTGTACCGCATGTTGGCAATTTTTAGGCTTATTCGTAGGGCGCTGTTCAGTGAGTTGATGGAACTCATACAAGCGATCGATAACCGCAGCCAGTTCAGCAAG > NC_000913/1577743‑1578340 | gttcagcagattatcaggcgcaactgaagcggcataatctgcgtggaagtatgagcgcaaaaggttgctgctacgataatgcctgcgtggaaagcttctttcattcgctgaaagtggaatgtatccatggagaacactttatcagccgggaaataatgcgggcaacggtgtttaattatatcgaatgtgattacaatcggtggcggcggcacagttggtgtggcggcctcagtccggaacaatttgaaaacaagaacctcgcttaggcctgtgtccatattacgtgggtaggatcatgtg > 1:723931‑M2/297‑300 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atattacgtgggtaggatcaTGTGACACATACCAACTGTCAGCAGGAGAAGAAATATTACCTTTAAACCACGGCCAGCAGTGGGATAATGTTTTAAGCAGTGTGGTTTTTCCCGCGCCAGAGTAGCCTTTCAGTCATAGCCATTTGCCTGGCGAAACATGAAAGTTCAGGTTCTCTAATATGATCTTATTATCAGGCGTACGAATACTCGCATCAGCCACTTGTACCGCATGTTGGCAATTTTTAGGCTTATTCGTAGGGCGCTGTTCAGTGAGTTGATGGAACTCATACAAGcgatcga > 2:418718‑M2/21‑300 (MQ=255) ttggATTAACGGTGTTTGTGACACATACCAACTGTCAGCAGTAGAAGAAATATCACCTTTAAACCACGGCCAGCAGTGGGATAATGGTTTAAGCAGTGTGGTTTTTCCCGCGCCAGAGTAGCCTTTCAGTAATAGCCATTTGCCTGGCGAAACATGAAAGTGCAGGTTCTCTAATATGATCTTATTATCAGGCGTACGAATACTCGCATCAGCCACTTGTACCGCATGTTGGCAATTTTTAGGCTTATTCGTAGGGCGCTGTTCAGTGAGTTGATGGAACTCATACAAGCGATCGATAAc < 1:167613/297‑1 (MQ=255) tacgtgggtaggatcaTGTGACACATACCAACTGTCAGCAGGAGAAGAAATATCACCTTTAAACCACGGCCAGCAGTGGGATAATGTTTTAAGCAGTGTGGTTTTTCCCGCGCCAGAGTAGCCTTTCAGTAATAGCCATTTGCCTGGCGAAACATGAAAGTTCAGGTTCTCTAATATGATCTTATTATCAGGCGTACGAATACTCGCATCAGCCACTTGTACCGCATGTTGGCAATTTTTAGGCTTATTCGTAGGGCGCTGTTCAGTGAGTTGATGGAACTCATACAAGCGATCGATAAc < 1:109933‑M2/284‑1 (MQ=255) 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GTAGTTTTTCACGCACTAAACGCAGTAAGCGGATAGCCTCTTGTTCCTCAAGATGAGAGGTAGTTTCGTCAAGAAATATCCATTTCGGACGTCGTAAAATTAATCGTGCCAGGGCGATACGTTGTTTTTCGCCGCTGGAAAGAATATCTCCCCAGCGATCGTGGTCATGAATACGCGCAGCCAATTTCCCAAGACCAACCTGATGCAGTACTTCGCTCAACGATTTATCGTCTACGGGCAGGGGAAGTGCTTTACAAATAATCTCTTTCAGTAAGCCGGTTTTGATTAACGGTGTTTGTGACACATACCAACTGTCAGCAGGAGAAGAAATATCACCTTTAAACCACGGCCAGCAGTGGGATAATGTTTTAAGCAGTGTGGTTTTTCCCGCGCCAGAGTAGCCTTTCAGTAATAGCCATTTGCCTGGCGAAACATGAAAGTTCAGGTTCTCTAATATGATCTTATTATCAGGCGTACGAATACTCGCATCAGCCACTTGTACCGCATGTTGGCAATTTTTAGGCTTATTCGTAGGGCGCTGTTCAGTGAGTTGATGGAACTCATACAAGCGATCGATAACCGCAGCCAGTTCAGCAAG > NC_000913/1577743‑1578340 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |