New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 1578039 = | 104 (1.020) | coding (1304/1686 nt) | yddA | ABC transporter family protein YddA |
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
GTAGTTTTTCACGCACTAAACGCAGTAAGCGGATAGCCTCTTGTTCCTCAAGATGAGAGGTAGTTTCGTCAAGAAATATCCATTTCGGACGTCGTAAAATTAATCGTGCCAGGGCGATACGTTGTTTTTCGCCGCTGGAAAGAATATCTCCCCAGCGATCGTGGTCATGAATACGCGCAGCCAATTTCCCAAGACCAACCTGATGCAGTACTTCGCTCAACGATTTATCGTCTACGGGCAGGGGAAGTGCTTTACAAATAATCTCTTTCAGTAAGCCGGTTTTGATTAACGGTGTTTGTGACACATACCAACTGTCAGCAGGAGAAGAAATATCACCTTTAAACCACGGCCAGCAGTGGGATAATGTTTTAAGCAGTGTGGTTTTTCCCGCGCCAGAGTAGCCTTTCAGTAATAGCCATTTGCCTGGCGAAACATGAAAGTTCAGGTTCTCTAATATGATCTTATTATCAGGCGTACGAATACTCGCATCAGCCACTTGTACCGCATGTTGGCAATTTTTAGGCTTATTCGTAGGGCGCTGTTCAGTGAGTTGATGGAACTCATACAAGCGATCGATAACCGCAGCCAGTTCAGC > NC_000913/1577743‑1578337 | gTAGTTTTTCACGCACTAAACGCAGTAAGCGGATAGCCTCTTGTTCCTCAAGATGAGAGGTAGTTTCGTCAAGAAATATCCATTTCGGACGTCGTAAAATTAATCGTGCCAGGGCGATACGTTGTTTTTCGCCGCTGGAAAGAATATCTCCCCAGCGATCGTGGTCATGAATACGCGCAGCCAATTTCCCAAGACCAACCTGATGCAGTACTTCGCTCAACGATTTATCGTCTACGGGCAGGGGAAGTGCTTTACAAATAATCTCTTTCAGTAAGCCGGTTTTGATTAACGGTGTTtgtg < 1:168526/300‑1 (MQ=255) 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atattacgtgggtaggatcaTGTGACACATACCAACTGTCAGCAGGAGAAGAAATATTACCTTTAAACCACGGCCAGCAGTGGGATAATGTTTTAAGCAGTGTGGTTTTTCCCGCGCCAGAGTAGCCTTTCAGTCATAGCCATTTGCCTGGCGAAACATGAAAGTTCAGGTTCTCTAATATGATCTTATTATCAGGCGTACGAATACTCGCATCAGCCACTTGTACCGCATGTTGGCAATTTTTAGGCTTATTCGTAGGGCGCTGTTCAGTGAGTTGATGGAACTCATACAAGcgatcga > 2:418718‑M2/21‑300 (MQ=255) attacgtgggtaggatcaTGTGACACATACCAACTGTCAGCAGGAGAAGAAATATCACCTTTAAACCACGGCCAGCAGTGGGATAATGTTTTAAGCAGTGTGGTTTTTCCCGCGCCAGAGTAGCCTTTCAGTAATAGCCATTTGCCTGGCGAAACATGAAAGTTCAGGTTCTCTAATATGATCTTATTATCAGGCGTACGAATACTCGCATCAGCCACTTGTACCGCATGTTGGCAATTTTTAGGCTTATTCGTAGGGCGCTGTTCAGTGAGTTGATGGAACTCATACAAGCGATCGATa < 1:731555‑M2/282‑1 (MQ=255) ttggATTAACGGTGTTTGTGACACATACCAACTGTCAGCAGTAGAAGAAATATCACCTTTAAACCACGGCCAGCAGTGGGATAATGGTTTAAGCAGTGTGGTTTTTCCCGCGCCAGAGTAGCCTTTCAGTAATAGCCATTTGCCTGGCGAAACATGAAAGTGCAGGTTCTCTAATATGATCTTATTATCAGGCGTACGAATACTCGCATCAGCCACTTGTACCGCATGTTGGCAATTTTTAGGCTTATTCGTAGGGCGCTGTTCAGTGAGTTGATGGAACTCATACAAGCGATCGATAAc < 1:167613/297‑1 (MQ=255) 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GTAGTTTTTCACGCACTAAACGCAGTAAGCGGATAGCCTCTTGTTCCTCAAGATGAGAGGTAGTTTCGTCAAGAAATATCCATTTCGGACGTCGTAAAATTAATCGTGCCAGGGCGATACGTTGTTTTTCGCCGCTGGAAAGAATATCTCCCCAGCGATCGTGGTCATGAATACGCGCAGCCAATTTCCCAAGACCAACCTGATGCAGTACTTCGCTCAACGATTTATCGTCTACGGGCAGGGGAAGTGCTTTACAAATAATCTCTTTCAGTAAGCCGGTTTTGATTAACGGTGTTTGTGACACATACCAACTGTCAGCAGGAGAAGAAATATCACCTTTAAACCACGGCCAGCAGTGGGATAATGTTTTAAGCAGTGTGGTTTTTCCCGCGCCAGAGTAGCCTTTCAGTAATAGCCATTTGCCTGGCGAAACATGAAAGTTCAGGTTCTCTAATATGATCTTATTATCAGGCGTACGAATACTCGCATCAGCCACTTGTACCGCATGTTGGCAATTTTTAGGCTTATTCGTAGGGCGCTGTTCAGTGAGTTGATGGAACTCATACAAGCGATCGATAACCGCAGCCAGTTCAGC > NC_000913/1577743‑1578337 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |