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Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
CAATCATCATTAGCTGGCGACTGGTTACTGACCCCTAAAGATAAAACCAGAGGATTAACGGGTAGCATTGCGGTAAATATTGCACCTTTCCGGTGTAAGACAAATTGCCGTGGTGATAACTTACCTGATAATACCCGCCGCTGGCAGTTGTCAGGCGGGAACGAAAAAGAACTTACTTATCTTCATAATATGTCAGCACAAGAAAAGGTCGGTTTAAATCCCGGTTGGCAATGCTACACCTCATTTTTTATGCGGGTTTGCCAGGGCAAGCCCGGCACTCGACCGATAGTCAATGAGGATTATGTCAGCGAAAGCGGATTTTTTGGCTCGATGATGCATGTCGGGATTATTGAGTTACGACGCTGCCAGTCAGAAAATTGCCAGCAAGAATTGAAAGCGATAAATACACATTAAAATAGTGAGTCCGGGAATGAAACCCGGACCTGAACATGTCTTATTGCGTGAATGTTTCTTTCATTTGATACTGCATTTCCCAGAGTTCAGTAAGCGAAATAACTTTTCTTGTTCTTGCTTCTTCACTTTGTACCCATAAGAAAGGGTAGAACGTGAAGGCTTCCGTTGCCGATAATTTTATT > NC_000913/715493‑716088 | cAATCATCATTAACTGGCGACTGGTTACTGACCCCTAAAGATAAAACCAGAGGATTAACGGGTAGCATTGCGGTAAATATTGCACCTTTCCGGTGTAAGACAAATTGCCGTGGTGATAACTTACCTGATAATACCCGCCGCTGGCAGTTGTCAGGCGGGAACGAAAAAGAACTTACTTATCTTCCTAATATTTCAGCACAAGAAAAGGTCGGTTTAAATCCCGGTTGGCAATGCTACACCTCATTTTTTATGCGGGTTTGCCAGGGCAAGCCCGGCACTCGACCGATAGTCAATGAGGAt > 1:766219/1‑300 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CAATCATCATTAGCTGGCGACTGGTTACTGACCCCTAAAGATAAAACCAGAGGATTAACGGGTAGCATTGCGGTAAATATTGCACCTTTCCGGTGTAAGACAAATTGCCGTGGTGATAACTTACCTGATAATACCCGCCGCTGGCAGTTGTCAGGCGGGAACGAAAAAGAACTTACTTATCTTCATAATATGTCAGCACAAGAAAAGGTCGGTTTAAATCCCGGTTGGCAATGCTACACCTCATTTTTTATGCGGGTTTGCCAGGGCAAGCCCGGCACTCGACCGATAGTCAATGAGGATTATGTCAGCGAAAGCGGATTTTTTGGCTCGATGATGCATGTCGGGATTATTGAGTTACGACGCTGCCAGTCAGAAAATTGCCAGCAAGAATTGAAAGCGATAAATACACATTAAAATAGTGAGTCCGGGAATGAAACCCGGACCTGAACATGTCTTATTGCGTGAATGTTTCTTTCATTTGATACTGCATTTCCCAGAGTTCAGTAAGCGAAATAACTTTTCTTGTTCTTGCTTCTTCACTTTGTACCCATAAGAAAGGGTAGAACGTGAAGGCTTCCGTTGCCGATAATTTTATT > NC_000913/715493‑716088 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |