Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 1,371,067 | C→A | G284G (GGC→GGA) | ycjM → | glucosylglycerate phosphorylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,371,067 | 0 | C | A | 98.9% | 311.3 / NA | 89 | G284G (GGC→GGA) | ycjM | glucosylglycerate phosphorylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (48/39); total (49/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCATTTATGGACCACCTTTAGTGACGATCAAATTGACCTGAATTACCGTAGCCCTGAAGTGTTGCTGGCGATGGTGGATGTTTTACTCTGTTACCTTGCGAAAGGTGCTGAGTATGTCCGCCTGGATGCCGTTGGCTTTATGTGGAAAGAGCCGGGAACAAGCTGCATCCATCTGGAAAAAACACATCTGATTATCAAACTGTTACGGTCGATTATTGATAACGTTGCGCCAGGTACAGTGATCATTACCGAGACCAATGTTCCGCATAAAGACAACATTGCTTACTTTGGCGCAGGCGATGACGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGTGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCGGGCTAAACCCGCTACGGGGCTTGTTGCCTGAAAGCGAAATATTAGAGCTGGTCGAGGCGTTACAGCAGGAAGGTGCATTAGTAAACTGGAAAAATAATCCCGACGGTACACGCAGTCCGTATGA > NC_000913/1370776‑1371360 | ccATTTATGGACCACCTTTAGTGACGATCAAATTGACCTGAATTACCGTAGCCCTGAAGTGTTGCTGGCGATGGTGGATGTTTTACTCTGTTACCTTGCGAAAGGTGCTGAGTATGTCCGCCTGGATGCCGTTGGCTTTATGTGGAAAGAGCCGGGAACAAGCTGCATCCATCTGGAAAAAACACATCTGNTTATCAAACTGTTACGGTCGATTATTGATAACGTTGCGCCAGGTACAGTGATCATTACCGAGACCAATGTTCCGCATAAAGACAACATTGCTTACTTTGGAGCAGGCGa > 1:518671/1‑300 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |