| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,899,195 | C→T | E67K (GAA→AAA) | yieK ← | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,899,195 | 0 | C | T | 99.2% | 416.9 / NA | 117 | E67K (GAA→AAA) | yieK | putative glucosamine‑6‑phosphate deaminase YieK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (53/63); minor base G (0/1); total (53/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
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GCCCAACTCGCCATGCGCCACAATATCAACCATCTCTCCCTGGATCGGGAACTCCACGGTTTGCTCATGGAAATGGGTCGTATTCGGCAAATTGCCACAAAAATGACCATCTGCACCTAATCCCAGCACCACCAAATCCAGTCCGCCTTCACGCGCCAGTTTCTGATCATGCTCGCGGTAGTTATCAATAGTGAGCTTCTGGATATTCTCTTCTTTGATCCCCGCAGGGGTGAAAAACAGATTACGCAGATTGGTAATCGTTACGCCTTCTCCCTCTTTGCCGCGAAATGGAATTTCATCAAAATTATAGAAATAGCAGTTATCGTACCAGGGCTTACCTTTAACCAGGGTGGTGAGGTATTCATACATGCCTTTGGGCGTGCTACCGGCGGTAATTGCCAGGTTAACACGACGCGTCTTCGACATATAACCAAGCAGATGGTGTGCCGCGACACGGCTCATTTCCTGGTAATCTTCGGTAATGATTAATTTCATCTTAATGCCTTATTTTATTTAAATAATTTCTGTACAAAGGCTGCATAGGCTGGTCGCCAGACATCCATTTCATGGTTCAGACCCGGATATTCC > NC_000913/3898899‑3899486 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |