| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,769,447 | G→A | E35K (GAA→AAA) | yibV → | PF15596 family protein YibV |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,769,447 | 0 | G | A | 99.3% | 535.5 / NA | 146 | E35K (GAA→AAA) | yibV | PF15596 family protein YibV |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (70/75); minor base C (0/1); total (70/76) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
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ggCTAAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACCAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATACGACCATATCTGCAAAATCTAAATCCACTACAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGGGTTAATAGTatta > 2:324322/1‑297 (MQ=255) ggCTAAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACta > 2:389238/1‑300 (MQ=255) ggCTAAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACta > 1:234082/1‑300 (MQ=255) | CGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTGCAGTTACTGCAAGACAATTTCAGAGAGAGTTAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTACTA > NC_000913/3769152‑3769742 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |