Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 1411925 | 1433822–1433669 | 21745–21898 | 90 [0] | [26] 30 | [ttcA]–pinR | [ttcA],intR,xisR,rcbA,ralA,ralR,recT,recE,racC,ydaE,kilR,kilS,sieB,ydaF,ydaG,racR,ydaS,ydaT,ydaU,ydaV,ydaW,rzoR,trkG,ynaK,ydaY,ynaA,lomR,insH5,lomR,stfR,tfaR,pinR |
AACGAATGCGTATGCAACCCCGTAATTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGAT > NC_000913/1433774‑1434122 | aaCGAATGCGTATGCAACCCCGTAATTTTGTTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCatgatg < 2:296074/300‑1 (MQ=11) aaCGAATGCGTATGCAACCCCGTAATTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGNAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCatgatg < 2:538034/300‑1 (MQ=11) aaCGAATGCGTATGCAACCCCGTAATTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCTTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCatgatg < 2:358054/300‑1 (MQ=11) aaCGAATGCGTATGCAACCCCGTAATTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCatgatg < 1:231515/300‑1 (MQ=11) tGCGTATGCAACCCCGTAATTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCt > 1:256015/1‑300 (MQ=31) tGCGTATGCAACCCCGTAATTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAAACAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATCTCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCt > 1:256195/1‑300 (MQ=14) gCGTATGCAACCCCGTAATTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAGTTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCAATGGTGTTTTCtt > 2:85952/1‑300 (MQ=14) gTATGCAACCCCGTAATTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTCTTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTCAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCCGCCATGATGTTTTCTTTa > 1:543875/1‑300 (MQ=14) gTATGCAACCCCGTAATTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTa > 1:74800/1‑300 (MQ=31) gTATGCAACCCCGTAATTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTAACATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTa > 2:231022/1‑300 (MQ=14) aTGCAACCCCGTAATTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATg > 1:135813/1‑300 (MQ=31) ccccGGAATTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGGGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCGTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGttttct < 2:414864/300‑4 (MQ=9) cccGTAATTTTGGTTAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAATGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCtt < 1:256510/300‑1 (MQ=14) cccGTAATTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAATGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCtt < 1:256210/300‑1 (MQ=14) aagtttGGTGAGACCCAAAGTCGATTTGGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGTAAGAAGAATATTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGGGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTGGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTGTTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATg < 2:253421/297‑1 (MQ=11) aTTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCTTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGt > 1:678788/1‑300 (MQ=14) tGGTTAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAACGGCTTTAACTCGGTTGGTTTTGCGAATTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTAGTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATc < 2:193988/300‑1 (MQ=9) ggTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAGATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCa < 2:329474/300‑1 (MQ=14) gagaCCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACGCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGTGCGGACTCAAGTAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTNAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTAGGTTTCCTTCAATGTAATCAAGc < 1:527544/300‑1 (MQ=9) gaCCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCaa < 1:70726/300‑1 (MQ=31) aaaaTCGATTTTTTGAAAAATGGCTTTAACTCGTTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTc < 2:701339/300‑1 (MQ=14) aaaaTCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTc < 1:418041/300‑1 (MQ=31) aTCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTgg < 1:698609/300‑1 (MQ=31) tgATTTTTTGAAAAATGGCTTGGGCTCGGTTTTTTTTTCGAGTTCCGTGCGGATGCAAGGGAGGAGAATAGTTTTGCGTGTTGTTTTAACCAGGGTTCAAGTTGGTGGTTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTCTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAGTTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTGTGTTTCCTTCAGTGTAATCAAGCAATGTTCTGGTa < 2:59316/299‑1 (MQ=11) cGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCTGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTGGCGTGTTATTTTAACCAGATGTCAAGTTGTTTGGNCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTCTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTa < 1:501818/300‑1 (MQ=9) cGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTa < 1:307769/300‑1 (MQ=31) ttGTGAAAAATGGCTTTAGCTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGTAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGAt < 2:186739/300‑1 (MQ=14) ttGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGTAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGAt < 2:371268/300‑1 (MQ=14) ttGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAATTTGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGAt < 2:101363/300‑1 (MQ=14) ttGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGAt < 1:440965/300‑1 (MQ=31) | AACGAATGCGTATGCAACCCCGTAATTTTGGTGAGACCCAAAATCGATTTTGTGAAAAATGGCTTTAACTCGGTTTGTTTTTCGAGTTCCGGGCGGACTCAAGGAAGAAGAATAGTGTTGCGTGTTATTTTAACCAGATTTCAAGTTGTTTGGTCGTGGAAAAGTGGAGCAAAATGTTGTTAAAGTGGAAAAATGATAAAAAAGTAAGTTTATTATATTACATTTTACCATTTAAATTTTGGTTGTCTTTAAGAACTGATATCGCTGTTTGTAATAATTCTTTGTTATCCAGCCATGATGTTTTCTTTATGTTTCCTTCAATGTAATCAAGCAATGTTCTGGTATTGAT > NC_000913/1433774‑1434122 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |