| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 755,780 | Δ7 bp | coding (221‑227/348 nt) | sdhD → | succinate:quinone oxidoreductase, membrane protein SdhD |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 755779 | 11 (0.120) | 92 (0.980) | 61/598 | 0.3 | 89.3% | coding (220/348 nt) | sdhD | succinate:quinone oxidoreductase, membrane protein SdhD |
| ? | NC_000913 | 755787 = | 11 (0.120) | coding (228/348 nt) | sdhD | succinate:quinone oxidoreductase, membrane protein SdhD | |||||
CATTCGAAGCGGGTAAACGCTCCGCCAAAATCTCCTTTGTTATTACTGTCGTGCTTTCACTTCTCGCAGGAGTCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/755481‑755779‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTTGATGCAGTTGTGATTGGTGCCGGTGGCGCAGGTATGCGCGCGGCGCTGCAAATTTCCCAGAGCGGCCAGACCTGTGCGCTGCTCTCTAAAGTCTTCCCGACCCGTTCCCATACCGTTTCTGCGCAAGGCGGCATTACCGTTGCGCTGGGTAATAC > NC_000913/755787‑756085 CATTCGAAGCGGGTAAACGCTCCGCCAAAATCTCCTTTGTTATTACTGTCGTGCTTTCACTTCTCGCAGGAGTCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGAG < 2:221815/300‑1CATTCGAAGCGGGTAAACGCTCCGCCAAAATCTCCTTTGTTATTACTGTCGTGCTTTCACTTCTCGCAGGAGTCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGAG < 1:68945/300‑1 ATTCGAAGCGGGTAAACGCTCCGCCAAAATCTCCTTTGTTATTACTGTCGTGCTTTCACTTCTCGCAGGAGTCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGAGT < 1:379053/300‑1 GCGGGTAAACGCTCCGCCAAAATCTCCTTTGTTATTACTGTCGTGCTTTCACTTCTCGCAGGAGTCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGAGTGGCAGGT > 1:591537/1‑300 GGGTAAACGCTCCGCCAAAATCTCCTTTGTTATTACTGTCGTGCTTGCACTTCTCGCAGGAGTCTTCGTATGGTAAACAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTATATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTNCCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGTTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTCTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGAGTGGCAGGTGT < 2:176941/300‑1 GGTAAACGCTCCGCCAAAATCTCCTTTGTTATTACTGTCGTGCTTTCACTTCTCGCAGGAGTCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGAGTGGCAGGTGTT > 2:437467/1‑300 GGTAAACGCTCCGCCAAAATCTCCTTTGTTATTACTGTCGTGCTTTCACTTCTCGCAGGAGTCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGAGTGGCAGGTGTT > 1:112918/1‑300 GGTAAACGCTCCGCCAAAATCTCCTTTGTTATTACTGTCGTGCTTTCACTTCTCGCAGGAGTCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCATGGAGTGGCAGGTGTT > 2:446440/1‑300 AAACGCTCCGCCAAAATCTCCTTTGTTATTACTGTCGTGCTTTCACTTCTCGCAGGAGTCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGAGTGGCAGGTGTTGAC < 1:213085/300‑1 AACGCTCCGCCAAAATCTCCTTTGTTATTACTGTCGTGCTTTCACTTCTCGCAGGAGTCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCACATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACACCATTTATATGGTCGGTTTTTTCNCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCNTGATCCATGCCTGGAGTGGCAGGTGTTGACC < 2:508750/300‑1 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TCTCCTTTGTTATTACTGTCGTGCTTTCACTTCTCGCAGGAGTCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGAGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCG < 1:141476/300‑1 TGTTATTACTGTCGTGCTTTCACTTCTCGCAGGAGTCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTAATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATNTTGATCCATGCCTGGAGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGNTGGCTT > 2:602607/1‑300 TTATTACTGTCGTGCTTTCACTTCTCGCAGGAGTCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGAGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTG > 1:55173/1‑300 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AGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTTGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTTGATGCAGTTGTGATTGGTGCCGGTGGCGCAGGTATGCGCGCGGCGCTGCAAATTTCCCAGAGCGGCCAGACCTGTGCGCTGCTCTCTAAAGTCTTCCCGACCCGTTCCCATACCGTTTCTGCGCAAGGCGGCATTACCGTTGCGCTGGGTAATAC < 1:8890/300‑1 AGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTTTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTTGATGCAGTTGTGATTGGTGCCGGTGGCGCAGGTATGCGCGCGGCGCTGCAAATTTCCCAGAGCGGCCAGACCTGTGCGCTGCTCTCTAAAGTCTTCCCGACCCGTTCCCATACCGTTTCTGCGCAAGGCGGCATTACCGTTGCGCTGGGTAATAC < 1:610296/300‑1 AGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTTGATGCAGTTGTGATTGGTGCCGGTGGCGCAGGTATGCGCGCGGCGCTGCAAATTTCCCAGAGCGGCCAGACCTGTGCGCTGCTCTCTAAAGTCTTCCCGACCCGTTCCCATACCGTTTCTGCGCAAGGCGACATTACCGTTGCGCTGGGTAATAC < 1:666041/300‑1 AGTGGCAGGTGTTGACCGACTACGGTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTTGATGCAGTTGTGATTGGTGCCGGTGGCGCAGGTATGCGCGCGGCGCTGCAAATTTCCCAGAGCGGCCAGACCTGTGCGCTGCTCTCTAAAGTCTTCCCGACCCGTTCCCATACCGTTTCTGCGCAAGGCGGCATTACCGTTGCGCTGGGTAATAC < 1:610287/300‑1 CATTCGAAGCGGGTAAACGCTCCGCCAAAATCTCCTTTGTTATTACTGTCGTGCTTTCACTTCTCGCAGGAGTCCTCGTATGGTAAGCAACGCCTCCGCATTAGGACGCAATGGCGTACATGATTTCATCCTCGTTCGCGCTACCGCTATCGTCCTGACGCTCTACATCATTTATATGGTCGGTTTTTTCGCTACCAGTGGCGAGCTGACATATGAAGTCTGGATCGGTTTCTTCGCCTCTGCGTTCACCAAAGTGTTCACCCTGCTGGCGCTGTTTTCTATCTTGATCCATGCCTGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/755481‑755779‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGCAGGTGTTGACCGACTACGTTAAACCGCTGGCTTTGCGCCTGATGCTGCAACTGGTGATTGTCGTTGCACTGGTGGTTTACGTGATTTATGGATTCGTTGTGGTGTGGGGTGTGTGATGAAATTGCCAGTCAGAGAATTTGATGCAGTTGTGATTGGTGCCGGTGGCGCAGGTATGCGCGCGGCGCTGCAAATTTCCCAGAGCGGCCAGACCTGTGCGCTGCTCTCTAAAGTCTTCCCGACCCGTTCCCATACCGTTTCTGCGCAAGGCGGCATTACCGTTGCGCTGGGTAATAC > NC_000913/755787‑756085 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |