| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 562,453 | IS2 (–) +5 bp | coding (118‑122/984 nt) | sfmH → | putative fimbrial adhesin protein SfmH |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | 114 (1.210) | 75/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 562457 | 0 (0.000) | coding (122/984 nt) | sfmH | putative fimbrial adhesin protein SfmH | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
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NC_000913/382293‑382590‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTTATTGGTGCTATTAAAGATATTTGAGAGATCATAGTGTTCATCTTCTGCTACGCCAGTACTATTTGCACAAACAGTAGCCCAGGATATGTTTGCCAGACACAAACATGCCATCGCCAATAATAATCTGCAGATTATCTTATTGATAATTTCCTTTATGAGCCAGGATGTGTGCAAACTGCCGAAATAACAGTGACGGCTTGCTGTAAGCTTTGCTTCGGCAATACATAGTGCGCAATGCAGCGTGAGTTCGCGCCGTCTCCCCACTGAACCAGTAATTCACCAGACAATGG < NC_000913/562457‑562163 AAACACGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCATG > 1:734834/1‑300 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ACAGACGTCTTGAAATATATTGTCAAATCTATGGTTATTGGTGCTAGGAGAGATATTTGAGAGATCATAGTGTTCATCTTCGGCTACGCCAGGACTATTTGCACAAACAGTAGCCCAGGATATGTTTGCCAGACACAAACATGCCATCGCCAATAATAATCTGCAGATTATCTTATTGATAATTTCCTTTATGAGCCAGGATGTGTGCAAACTGCCGAAATAACAGTGACGGCGTGCTGTAAGCTTTGCTTCGGCAATACATAGTGCGCAATGCAGCGTGAGTTCGCGCCGTCTCCCCAC < 2:46938/300‑1 TGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCATGGTTATTGGTGCTATTAAAGATATTTGAGAGATCATAGTGTTCATCTTCTGCTACGCCAGTACTATTTGCACAAACAGTAGCCCAGGATATGTTTGCCAGACACAAACATGCCATCGCCAATAATAATCTGCAGATTATCTTATTGATAATTTCCTTTATGAGCCAGGATGTGTGCAAACTGCCGAAATAACAGTGACGGCTTGCTGTAAGCTTTGCTTCGGCAATACATAGTGCGCAATGCAGCGTGAGTTCGCGCCGTCTCCCCACTGAAC > 1:369683/1‑300 TATAGGGGCAAATCCATGGTTATTGGTGCTATTAAAGATATTTGAGAGATCATAGTGTTCATCTTCTGCTACGCCAGTACTATTTGCACAAACAGTAGCCCAGGATATGTTTGCCAGACACAAANATGCCATCGCCAATAATAATCTGCAGNTTATCTTATTGATAATTTCCTTTATGAGCCAGGATGTGTGCAAACTGCCGAAATAACAGTGACGGCTTGCTGTAAGCTTTGCTTCGGCAATACATAGTGCGCAATGCAGCGTGAGTTCGCGCCGTCTCCCCACTGAACCAGTAATTCA > 2:487716/1‑300 GGGCAAATCCATGGTTATTGGTGCTATTAAAGATATTTGAGAGATCATAGTGTTCATCTTCTGCTACGCCAGTACTATTTGCACAAACAGTAGCCCAGGATATGTTTGCCAGACACAAACATGCCATCGCCAATAATAATCTGCAGATTATCTTATTGATAATTTCCTTTATGAGCCAGGATGTGTGCAAACTGCCGAAATAACAGTGACGGCTTGCTGTAAGCTTTGCTTCGGCAATACATAGTGCGCAATGCAGCGTGAGTTCGCGCCGTCTCCCCACTGAACCAGTAATTCACCAGA > 1:667281/1‑300 GCAAATCCATGGTTATTGGTGCTATTAAAGATATTTGAGAGATCATAGTGTTCATCTTCTGCTACGCCAGTACTATTTGCACAAACAGTAGCCCAGGATATGTTTGCCAGACACAAACATGCCATCGCCAATAATAATCTGCAGATTATCTTATTGATAATTTCCTTTATGAGCCAGGATGTGTGCAAACTGCCGAAATAACAGTGACGGCTTGCTGTAAGCTTTGCTTCGGCAATACATAGTGCGCAATGCAGCGTGAGTTCGCGCCGTCTCCCCACTGAACCAGTAATTCACCACACA < 1:699544/300‑1 ATCCATGGTTATTGGTGCTATTAAAGATATTTGAGAGATCATAGTGTTCATCTTCTGCTACGCCAGTACTATTTGCACAAACAGTAGCCCAGGATATGTTTGCCAGACACAAACATGCCATCGCCAATAATAATCTGCAGATTATCTTATTGATAATTTCCTTTATGAGCCAGGATGTGTGCAAACTGCCGAAATAACAGTGACGGCTTGCTGTAAGCTTTGCTTCGGCAATACATAGTGCGCAATGCAGCGTGAGTTCGCGCCGTCTCCCCACTGAACCAGTAATTCACCAGACAATGG > 1:561436/1‑300 AAACACGCCAGTTCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/382293‑382590‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTTATTGGTGCTATTAAAGATATTTGAGAGATCATAGTGTTCATCTTCTGCTACGCCAGTACTATTTGCACAAACAGTAGCCCAGGATATGTTTGCCAGACACAAACATGCCATCGCCAATAATAATCTGCAGATTATCTTATTGATAATTTCCTTTATGAGCCAGGATGTGTGCAAACTGCCGAAATAACAGTGACGGCTTGCTGTAAGCTTTGCTTCGGCAATACATAGTGCGCAATGCAGCGTGAGTTCGCGCCGTCTCCCCACTGAACCAGTAATTCACCAGACAATGG < NC_000913/562457‑562163 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |