Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 735,613 | IS5 (+) +4 bp | intergenic (+1511/‑34) | ybfB → / → ybfC | uncharacterized protein YbfB/uncharacterized protein YbfC |
New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 273955 = | NA (NA) | 118 (1.260) | 87/598 | 0.0 | 100% | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | 735613 = | 0 (0.000) | intergenic (+1511/‑37) | ybfB/ybfC | uncharacterized protein YbfB/uncharacterized protein YbfC | |||||
* | ? | NC_000913 | = 275149 | NA (NA) | 109 (1.170) | 80/596 | 0.0 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | = 735616 | 0 (0.000) | intergenic (+1514/‑34) | ybfB/ybfC | uncharacterized protein YbfB/uncharacterized protein YbfC |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/274862‑275149 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTAGCTAAAATTTCACCCAAATCATCTATCCCTGCTGTTGCTGGCCCATCGGGTTTATTAATGTCTGGGAATAAATAGGGTTCTGCACAAGTATATCCTGGTGGTAATTGAGTTGTTGGCCAATTTGTCTGTGGCAGGTAATCACTTGCTGTCTTTGTATCCATCCCTGGATACTGGGAATCATCCTGTGGCGTACAAGTCAGATTTGGTTTTACCCACTTCCTGCAATACAGTGTGTAGTCGTAAGGGCTTAATGCTCTGAAGAATGTTTTGAAAACATTAGGCGCACTACTGGCC < NC_000913/735616‑735320 CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGNATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGNAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGCTAAAATT > 2:520680/1‑300 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CACCTTCCTTAGCTAAAATTTCACCCAAATCACCTATCCCTGCTGTTGCTGGCCCATCGGGTTTATTAATGTCTGGGAATAAATAGGGTTCTGCACAAGTATATCCTGGTGGTAATTGAGTTGTTGGCCAATTTGTCTGTGGCAGGTAATCACTTGCTGTCTTTGTATCCATCCCNGGATACTGGGAATCATCCTGTGGCGTACAAGTCAGATTTGGTTTTACCCACTTCCTGCAATACAGTGTGTAGTCGTAAGGGCTTAATGCTCTNAAGAATGTTTTGAAAACATTAGGCGCACTAC < 2:507509/300‑1 TTCCTTAGCTAAAATTTCACCCAAATCATCTATCCATGCTGTTGCTGGCCCATCGGGTTTATTAATGTCTGGGAATAAATAGGGTTCTGCACAAGTATATCCTGGTGGTAATTGAGTTGTTGGCCAATTTGTCTGTGGCAGGTAATCACTTGCTGTCTTTGTATCCATCCCTGGATACTGGGAATCATCCTGTGGCGTACAAGTCAGATTTGGTTTTACCCACTTCCTGCAATACAGTGTGTAGTCGTAAGGGCTTAATGCTCTGAAGAATGTTTTGAAAACATTAGGCGCACTACTGGC > 1:358262/1‑300 TCCTTAGCTAAAATTTCACCCAAATCATCTATCCCTGCTGTTGCTGGCCCATCGGGTTTATTAATGTCTGGGAATAAATAGGGTTCTGCACAAGTATATCCTGTTGGTAATTGAGTTGTTGGCCAATTTGTCTGTGGCAGGTAATCACTTGCTGTCTTTGTATCCATCCCTGGATACTGGGAATCATCCTGTGGCGTACAAGTCAGATTTGGTTTTACCCACTTCCTGCAATACAGTGTGTAGTCGTAAGGGCTTAATGCTCTGAAGAATGTTTTGAAAACATTAGGCGCACTACTGGCC < 2:364134/300‑1 TCCTTAGCTAAAATTTCACCCAAATCATCTATCCCTGCTGTTGCTGGCCCATCGGGTTTATTAATGTCTGGGAATAAATAGGGTTCTGCACAAGTATATCCTGGTGTTAATTGAGTTGTTGGCCAATTTGTCTGTGGCAGGTAATCACTTGCTGTCTTTGTATCCATCCCTGGATACTGGGAATCATCCTGTGGCGTACAAGTCAGATTTGGTTTTACCCACTTCCTGCAATACAGTGTGTAGTCGTAAGGGCTTAATGCTCTGAAGAATGTTTTGAAAACATTAGGCGCACTACTGGCC < 1:281458/300‑1 TCCTTAGCTAAAATTTCACCCAAATCATCTATCCCTGCTGTTGCTGGCCCATCGGGTTTATTAATGTCTGGGAATAAATAGGGTTCTGCACAAGTATATCCTGGTGGTAATTGAGTTGTTGGCCAATTTGTCTGTGGCAGGTAATCACTTGCTGTCTTTGTATCCATCCCTGGATACTGGGAATCATCCTGTGGCGTACAAGTCAGATTTGGTTTTACCCACTTCCTGCAATACAGTGTGTAGTCGTAAGGGCTTAATGCTCTGAAGAATGTTTTGAAAACATTAGGCGCACTACTGGCC < 2:393619/300‑1 TCCTTAGCTAAAATTTCACCCAAATCATCTATCCCTGCTGTTGCTGGCCCATCGGGTTTATTAATGTCTGGGAATAAATAGGGTTCTGCACAAGTATATCCTGGTGGTAATTGAGTTGTTGGCCAATTTGTCTGTGGCAGGTAATCACTTGCTGTCTTTGTATCCATCCCTGGATACTGGGAATCATCCTGTGGCGTACAAGTCAGATTTGGTTTTACCCACTTCCTGCAATACAGTGTGTAGTCGTAAGGGCTTAATGCTCTGAAGAATGTTTTGAAAACATTAGGCGCACTACTGGCC < 1:191349/300‑1 CGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/274862‑275149 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTAGCTAAAATTTCACCCAAATCATCTATCCCTGCTGTTGCTGGCCCATCGGGTTTATTAATGTCTGGGAATAAATAGGGTTCTGCACAAGTATATCCTGGTGGTAATTGAGTTGTTGGCCAATTTGTCTGTGGCAGGTAATCACTTGCTGTCTTTGTATCCATCCCTGGATACTGGGAATCATCCTGTGGCGTACAAGTCAGATTTGGTTTTACCCACTTCCTGCAATACAGTGTGTAGTCGTAAGGGCTTAATGCTCTGAAGAATGTTTTGAAAACATTAGGCGCACTACTGGCC < NC_000913/735616‑735320 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |