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New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 106 (1.130) | 65/598 | 0.2 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
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Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
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TCACCAACGCTTAATATCATTATGGGGAATAAATAAAAGGTAATTCATGGATGGTTGAACTATATCCCTGCTTTTCAACCATCCTAAAAAAGCATGAATTGCTCGCTCTGCCCTAAGTGGCTGTGCTATTTTAGAAAAACTTAATCCTGAGTTAAGCAAAAAAACATAATCAATAAAAATATATACGCAAAAAACATTGATTAAGTGAATATATCATGGAAGAAAAATATAACCGGAGTAGTGTATGGCCAATCTCTACGACTTGAAAAAGTTCGACTTAAATCTTCTTGTCATATTTGA > 1:289468/1‑300 CACCAACGCTTAATATCATTATGGGGAATAAATAAAAGGTAATTCATGGATGGTTGAACTATATCCCTGCTTTTCAACCATCCTAAAAAAGCATGAATTGCTCGCTCTGCCCTAAGTGGCTGTGCTATTTTANAAAAACTTAATCCTGAGTTAAGCAAAAAAACATAATCAATAAAAATATATACGCAAAAAACATTGATTAAGTGAATATATCATGGAAGAAAAATATAACCGGAGTAGTGTATGGCCAATCTCTACGACTTGAAAAAGTTCGACTTAAATCTTCTTGTCATATTTGAG < 2:158614/300‑1 CACCAACGCTTAATATCATTATGGGGAATAAATAAAAGGTAATTCATGGATGGTTGAACTATATCCCTGCTTTTCAACCATCCTAAAAAAGCATGAATTGCTCGCTCTGCCCTAAGTGGCTGTGCTATTTTAGAAAAACTTAATCCTGAGTTAAGCAAAAAAACATAATCAATAAAAATATATACGCAAANAACATTGATTAAGTGAATATATCATGGAAGAAAAATATAACCGGAGTAGTGTATGGCCAATCTCTACGACTTGAAAAAGTTCGACTTAAATCTTCTTGTCATATTTGAG > 1:497858/1‑300 AATCGTGTTGAGGCCAACGCCCATAATGCGGGCTGTTGCCCGGCATCCAACGCCATTCATGGCCATATCAATGATTTTCTGGTGCGTACCGGGTTGAGAAGCGGTGTAAGTGAACTGCAGTTGCCATGTTTTACGGCAGTGAGAGCAGAGATAGCGCTGATGTCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/258381‑258675 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AACGCTTAATATCATTATGGGGAATAAATAAAAGGTAATTCATGGATGGTTGAACTATATCCCTGCTTTTCAACCATCCTAAAAAAGCATGAATTGCTCGCTCTGCCCTAAGTGGCTGTGCTATTTTAGAAAAACTTAATCCTGAGTTAAGCAAAAAAACATAATCAATAAAAATATATACGCAAAAAACATTGATTAAGTGAATATATCATGGAAGAAAAATATAACCGGAGTAGTGTATGGCCAATCTCTACGACTTGAAAAAGTTCGACTTAAATCTTCTTGTCATATTTGAG < NC_000913/637857‑637562 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |