New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | 73 (0.680) | 51/598 | 0.8 | 57.5% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | 2992202 = | 54 (0.510) | coding (109/1377 nt) | ygeH | putative transcriptional regulator YgeH |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
CTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTACTGAAAGATATGATCATCGAATCAGTATGGAAAAATATTATTGTTAGTGACGAGTCCCTGACAAGATGTATCTATTCTTTGCGCTGCATTTTTGAAAAAATTGGCTATGATCGTTGCATAGAAACAATCTACCGGAAAGGTTATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATT > NC_000913/2991904‑2992497 | tttATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGgt < 1:797151/300‑1 (MQ=255) 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tgttcgcaccttccTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTACTGAAAGATATGATCATCGAATCAGTATGGAAAAATATTATTGTTAGTGACGAGTCCCTGACAAGATGTATCTATTCTTTGCGCTGCATTTTTGAAAAAATTGGCTATGATCGTTGCATAGAAACAATCTACCGGAAAGGTTATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATacac > 1:474374‑M2/15‑300 (MQ=255) gttcgcaccttccTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTACTGAAAGATATGATCATCGAATCAGTATGGAAAAATATTATTGTTAGTGACGAGTCCCTGACAAGATGTATCTATTCTTTGCGCTGCATTTTTGAAAAAATTGGCTATGATCGTTGCATAGAAACAATCTACCGGAAAGGTTATCGTTTAAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTCTTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTGCTTCATTGAATACACt > 2:230237‑M2/14‑300 (MQ=255) gttcacaccttccTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTACTGAAAGATATGATCATCGAATCAGTATGGAAAAATATTATTGTTAGTGACGAGTCCCTGACAAGATGTATCTATTCTTTGCGCTGCATTTTTGAAAAAATTGGCTATGATCGTTGCATAGAAACAATCTACCGGAAAGGTTATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACt < 1:316000‑M2/287‑1 (MQ=255) 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CTACTTTATCAAAATTGAATAAGGCTATTTCAGATTACATCACTGAATTCCTAAGATAAATTAGTGAACACAACCATAGATATGTCAAATGTAATTTCCTGTAGCGTTAATGACACATAAATATGAATAGCCATAATTTCTATTGCTTAAGCAGGATGCAAGAAACCAATTTTTTCATAGAGGTTAACTAATGGACTTAGAAAATAAATTCTCATATCATTTTCTTGAGGGATTAACGCTCACGGAAGATGGAATTCTTACTCAAGGAAATGAGCAAGTTTATATTCCACAGAAAGAGTTAGGTGTATTAATAGTATTACTTGAATCCGCTGGTCATGTTGTACTGAAAGATATGATCATCGAATCAGTATGGAAAAATATTATTGTTAGTGACGAGTCCCTGACAAGATGTATCTATTCTTTGCGCTGCATTTTTGAAAAAATTGGCTATGATCGTTGCATAGAAACAATCTACCGGAAAGGTTATCGTTTCAGCGGGCAGGTTTTCAAAACTAAAATTAATGAAGATAATACTTCAGACTATTCCATAGCTATATTCCCTTTCACTACTTCATTGAATACACTGGATCCATT > NC_000913/2991904‑2992497 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |