| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 571,260 | IS2 (–) +5 bp | coding (368‑372/552 nt) | ybcL → | periplasmic protein YbcL |
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| * | ? | NC_000913 | = 382590 | NA (NA) | 120 (1.130) | 80/596 | 0.1 | 100% | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 571264 | 0 (0.000) | coding (372/552 nt) | ybcL | periplasmic protein YbcL | |||||
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gagattgagggggccagtctaCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTa < 1:654507‑M2/279‑1 (MQ=255) gattcagggggccagtctaCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTTTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATg < 1:78790‑M2/281‑1 (MQ=255) ttcagggggccagtctaCTGGGTTTGTTGGCGCATGTCCTCCTAAAGTAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTGAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTTAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGcc < 1:315371‑M2/283‑1 (MQ=255) ggccagtctaCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTtg > 1:636553‑M2/11‑300 (MQ=255) cagtctaCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAATGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTgtgt < 1:499678‑M2/293‑1 (MQ=255) agtctaCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTc > 1:457228‑M2/7‑300 (MQ=255) agtctaCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAACACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCATCTTATGCCAGCTTTGTGTc > 2:519772‑M2/7‑300 (MQ=255) gtctaCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTCATAAAATCGCCACCGCTGAGATACCACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGGGTATGCTGGCCAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAAAATCATGGGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTCg > 1:167018‑M2/6‑300 (MQ=255) ctaCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATAAGATTCATAGGGTTAAGCCTATTATGCCAGCTTTGTGTCGTa > 1:139968‑M2/4‑300 (MQ=255) | GGTCACTAGTAATGAAATAAAAACAGGAGAGCAACTTACAACGTCTCATGTCTTTTCTGGATTTGGGTGTGAAGGTGGTAATACATCGCCCTCATTAACCTGGTCTGGTGTTCCTGAAGGTACCAAAAGCTTTGCCGTAACTGTATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTCGTATCC > NC_000913/570961‑571559 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |