| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 3,991,038 | IS30 (+) +2 bp | intergenic (‑272/‑114) | hemC ← / → cyaA | hydroxymethylbilane synthase/adenylate cyclase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3991039 | 0 (0.000) | 116 (1.090) | 71/598 | 0.2 | 100% | intergenic (‑273/‑114) | hemC/cyaA | hydroxymethylbilane synthase/adenylate cyclase |
| ? | NC_000913 | = 4508679 | NA (NA) | noncoding (1/1221 nt) | IS30 | repeat region | |||||
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TCTTAAAACATTGTCTAACATGCTTGTTACCGTCATTATCATCCGTGGTCCATCCTAACATCCTTGCCAGAGTGATGTCAGTGTTGTGGTGAAACGTAGACGCCTGCGCAAACCGTAAAATGAGGTCTGGCAGTGGATCCTGACAGGCGTTTCACGCCGTTGTAATAAGGAATTTACAGAGAATAAACGGTGCTACACTTGTATGTAGCGCATCTTTCTTTACGGTCAATCAGCAAGGTGTTAAATTGATCACGTTTTAGACCATTTTTTCGTCGTGAAACTAAAAAAACCAGGCGCGAAAAGTGGTAACGGTTACCTTTGACATACGAAATATCCCGAATGCCGCGTGTTACCGTTGATGTTGGCGGAATCACAGTCATGACGGGTAGCAAATCAGGCGATACGTCTTGTACCTCTATATTGAGACTCTGAAACAGAGACTGGATGCCATAAATCAATTGCGTGTGGATCGCGCGCTTGCTGCTATGGGGCCTGCATTCCAACAGGTCTACAGTCTACTGCCGACATTGTTGCACTATCACCATCCGCTAATGCCGGGTTACCTTGATGGTAACGTTCCCAAAGGCATTTGC > NC_000913/3990746‑3991338 | ttAAAACATTGTCTAACATGCTTGTTACCGTCATTATCATCCGTGGTCCATCCTAACATCCTTGCCAGAGTGATGTCAGTGTTGTGGTGAAACGTAGACGCCTGCGCAAACCTTAAAATGAGGTCTGGCAGTGGATCCTGACAGGCGTTTCACGCCGTTGTAATAAGGAATTTACAGAGAATAAACGGTGCTACACTTGTATGTAGCGCATCTTTCTTTACGGTCAATCAGCAAGGTGTTAAATTGATCACGTTTTAGACCATTTTTTCGTCGTGAAACTAAAAAAACCAGGtgtagatt < 2:122430‑M1/300‑9 (MQ=255) 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tGTTACCGTCATTATCATCCGTGGTCCATCCTAACATCCTTGCCAGAGTGATGTCAGTGTTGTGGTGAAACGTAGACGCCTGCGCAAACCGTAAAATGAGGTCTGGCAGTGGATCCTGACAGGCGTTTCACGCCGTTGTAATAAGGAATTTACAGAGAATAAACGGTGCTACACTTGTATGTAGCGCATCTTTCTTTACGGTCAATCAGCAAGGTGTTAAATTGATCACGTTTTAGACCATTTTTTCGTCGTGAAACTAAAAAAACCAGGtgtagattcaattggtcaacgcaacagtta < 1:726894‑M1/300‑31 (MQ=255) ttACCGTCATTATCATCCGTGGTCCATCCTAACATCCTTGCCAGAGTGATGTCAGTGTTGTGGTGAAACGTAGACGCCTGCGCAAACCGTAAAATGAGGTCTGGCAGTGGATCCTGACAGGCGTTTCACGCCGTTGTAATAAGGAATTTACAGAGAATAAACGGTGCTACACTTGTATGTAGCGCATCTTTCTTTACGGTCAATCAGCAAGGTGTTAAATTGATCACGTTTTAGACCATTTTTTCGTCGTGAAACTAAAAAAACCAGGtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatg < 2:371809‑M1/300‑33 (MQ=255) aTTATCATCCGTGGTCCATCCTAACATCCTTGCCAGAGTGATGTCAGTGTTGTGGTGAAACGTAGACGCCTGCGCAAACCGTAAAATGAGGTCTGGCAGTGGATCCTGACAGGCGTTTCACGCCGTTGTAATAAGGAATTTACAGAGAATAAACGGTGCTACACTTGTATGTAGCGCATCTTTCTTTACGGTCAATCAGCAAGGTGTTAAATTGATCACGTTTTAGACCATTTTTTCGTCGTGAAACTAAAAAAACCAGGtgtagattcaattggtcaacgcaacagttatgtgaaaaca < 2:176987‑M1/300‑41 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |