| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,129,640 | IS5 (–) +4 bp | coding (8‑11/747 nt) | wcaE ← | GDP‑Fuc:2/3‑O‑Ac‑alpha‑L‑Fuc‑(1‑>3)‑alpha‑D‑Glc‑ PP‑Und alpha‑(1,4)‑fucosyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| ? | NC_000913 | = 2129643 | 0 (0.000) | coding (8/747 nt) | wcaE | GDP‑Fuc:2/3‑O‑Ac‑alpha‑L‑Fuc‑(1‑>3)‑alpha‑D‑Glc‑ PP‑Und alpha‑(1,4)‑fucosyltransferase | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2102943 | NA (NA) | 117 (1.100) | 73/598 | 0.2 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2129640 = | 0 (0.000) | coding (11/747 nt) | wcaE | GDP‑Fuc:2/3‑O‑Ac‑alpha‑L‑Fuc‑(1‑>3)‑alpha‑D‑Glc‑ PP‑Und alpha‑(1,4)‑fucosyltransferase | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
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NC_000913/2102650‑2102943‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAAGCAACATGTTCTTATTCTTACCTCGTAATATTTAACGCTTTTCGCAAAATAAACGGACAGACGATTAAAAATGCATATTCCGGGCTAAATATCGAACCGGTAAAAAACAGCGATACCGGAGTAAAAAGATATAATTGCACGCGAAAATTGCGGTTATCACCAAAAGCGTTGATCATCATTTTTATCACTTTCCCCATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACAAACCATTGTCTATGGTTTTTCCGACATCCGCACCGTTAAA > NC_000913/2129640‑2129936 CGCCATCGCTCAGTTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCCTAAGC < 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CCTTCCCTAAGCAACATGTTCTTATTCTTACCTCGTAATATTTAACGCTTTTCGCAAAATAAACGGACAGACGATTAAAAATGCATATTCCGGGCTAAATATCGAACCGGTAAAAAACAGCGATACCGGAGTAAAAAGATATAATTGCACGCGAAAATTGCGGTTATCACCAAAAGCGTTGATCATCATTNTTATCACTTTCCCCATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACAAACCATTGTCTATGGTTTTTCCGACATCCGCACCGTT > 1:631876/1‑300 TCCCTAAGCAACATGTTCTTATTCTTACCTCGTAATATTTAACGCTTTTCGCAAAATAAACGGACAGACGATTAAAAATGCATATTCCGGGCTAAATATCGAACCGGTAAAAAACAGCGATACCGGAGTAAAAAGATATAATTGCACGCGAAAATTGCGGTTATCACCAAAAGCGTTGATCATCATTTTTNTCACTTTCCCCATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACAAACCATTGTCTATGGTTTTTCCGACATCCGCACCGTTAAA > 1:612203/1‑300 TCCCTAAGCAACATGTTCTTATTCTTACCTCGTAATATTTAACGCTTTTCGCAAAATAAACGGACAGACGATTAAAAATGCATATTCCGGGCTAAATATCGAACCGGTAAAAAACAGCGATACCGGAGTAAAAAGATATAATTGCACGCGAAAATTGCGGTTATCACCAAAAGCGTTGATCATCATTTTTATCCCTTTCCCCATGTAACACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACAAACCATTGTCTATGGTTTTTACGAAATCCGCACCGTTAAA > 2:550292/1‑300 TCCCTAAGCAACATGTTCTTATTCTTACCTCGTAATATTTAACGCTTTTCGCAAAATAAACGGACAGACGATTAAAAATGCATATTCCGGGCTAAATATCGAACCGGTAAAAAACAGCGATACCGGAGTAAAAAGATATAATTGCACGCGAAAATTGCGGTTATCACCAAAAGCGTTGATCATCATTTTTATCACTTTCCCCATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACAAACCATTGTCTATGGTTTTTCCGACATCCGCACCGTTAAA > 2:550114/1‑300 TCCCTAAGCAACATGTTCTTATTCTTACCTCGTAATATTTAACGCTTTTCGCAAAATAAACGGACAGACGATTAAAAATGCATATTCCGGGCTAAATATCGAACCGGTAAAAAACAGCGATACCGGAGTAAAAAGATATAATTGCACGCGAAAATTGCGGTTATCACCAAAAGCGTTGATCATCATTTTTATCACTTTCCCCATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACAAACCATTGTCTATGGTTTTTCCGACATCCGCACCGTTAAA > 1:429853/1‑300 TCCCTAAGCAACATGTTCTTATTCTTACCTCGTAATATTTAACGCTTTTCGCAAAATAAACGGACAGACGATTAAAAATGCATATTCAGGGCTAAATATCGAACCGGTAAAAAACAGCGATACCGGAGTAAAAAGATATAATTGCACGCGAAAATTGCGGTTATCACCAAAAGCGTTGATCATCATTTTTATCACTTTCCCCATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACAAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACAAACCACTGTCTATGGTTTTTCCGACATCCGCACAGTTAAA > 1:829300/1‑300 CGCCATCGCTCAGGTTGTACCAATGCTGCATGCAGTGAATGCGTAGCATGGTTTCCAGCGGATAAGGTCGCCGGCCATTACCAGCCTTGGGGTAAAACGGCTCGATGACTTCCACCATGTTTTGCCATGGCAGAATCTGCTCCATGCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2102650‑2102943‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAAGCAACATGTTCTTATTCTTACCTCGTAATATTTAACGCTTTTCGCAAAATAAACGGACAGACGATTAAAAATGCATATTCCGGGCTAAATATCGAACCGGTAAAAAACAGCGATACCGGAGTAAAAAGATATAATTGCACGCGAAAATTGCGGTTATCACCAAAAGCGTTGATCATCATTTTTATCACTTTCCCCATGTACCACAGTGATAAAAACACCGCGAACCAGGAAAAATAAATAATCAGCAGATACAAACCATTGTCTATGGTTTTTCCGACATCCGCACCGTTAAA > NC_000913/2129640‑2129936 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |