Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 1,655,935 | IS2 (–) +5 bp | coding (128‑132/342 nt) | ynfB → | DUF1283 domain‑containing protein YnfB |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | 98 (0.920) | 67/598 | 0.3 | 100% | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
? | NC_000913 | = 1655939 | 0 (0.000) | coding (132/342 nt) | ynfB | DUF1283 domain‑containing protein YnfB |
TCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1651263‑1651548 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCGGCTTTGTGCACTGTCGCCAGACTCAATCACCAGTTTGTTAGTTTCGGCATGAACAGTTGTGCTCAATGCCAGTGCGCAAGGCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTAC < NC_000913/1655939‑1655642 TCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCGGCTTTGTGCAC < 1:638016/300‑1 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AGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCGGCTTTGTGCACTGTCGCCAGACTCAATCACCAGTTTGTTAGTTTCGGCATGAACAGTTGTGCTCAATGCCAGTGCGCAAGGCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGAC > 1:323383/1‑300 AGTGATAACAGACGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCGGCTTTGTGCATTGTCGACAGACTCAATCACCAGTTTGTTAGTTTCGGCATGAACAGTTGTGCTCCATGCCAGCGCGCAAGGCAGCAGAATAGCAAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTCTGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGGCGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGACGATACTATGTCGCCCTACAACTATACATGATGTCAATAAGAGAC > 2:334256/1‑300 tgctcacagctttcttgaacTATAGGGGCCAATCCAGCGGCTTTGTGCACTGTCGCCAGCCTCCATCACCAGTTTGTTCGTTTCGGCATGAACAGTTGTGCTCAATGCCAGTGCGCAAGGCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCACTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTCTATTGACGATATTATGTCGACATATAACTATACATGATGTCAATAAGAGGCAA > 2:271240/21‑300 TGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCGGCTTTGTGCACTGTCGACAGACTCAATCAACAGTTTGTTAGTTTCGGCATGAACAGTTGTGCTCAATGCCAGTGCGCAAGGCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCCAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCACTATAACTATACATGATGTAAATAAGAGACAA > 2:224545/1‑300 GATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCGGCTTTGTGCACTGTCGCCAGACTCAATCACCAGTTTGTTAGTTTCGGCATGAACAGTTGTGCTCAATGCCAGTGCGCAAGGCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAA > 2:327481/1‑300 TAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCGGCTTTGTGCACTGTCGCCAGACTCAATCACCAGTTTGTTAGTTTCGGCATGAACAGTTGTGCTCAATGCCAGTGCGCAAGGCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGA > 1:701447/1‑300 GTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCGGCTTTGTGCACTGTCGCCAGACTTAATCACCAGTTTGTTAGTTTCGGCATGAACAGTTGTGCTCAATGCCAGTGCGCAAGGCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAA > 1:456294/1‑300 CTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCGGCTTTGTGCACTGTCGCCAGACTCAATCACCAGTTTGTTAGTTTCGGCATGAACAGTTGTGCTCAATGCCAGTGCGCAAGGCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAAC < 1:761931/300‑1 CTGGAAATATAGGGGCAAATCCAGCGGCTTTGTGCACTGTCGCCAGACTCAATCACCAGTTTGTTAGTTTCGGCATGAACAGTTGTGCTCAATGCCAGTGCGCAAGGCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACAGGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAAC < 1:762736/300‑1 CAGCGGCTTTGTGCACTGTCGCCAGACTCAATCACCAGTTTGTTAGTTTCGGCATGAACAGTTGTGCTCAATGCCAGTGCGCAAGGCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTAC < 1:89541/300‑1 TCGCCCGGATGTTGGGACTTGAACCGAAGAACACGGCGGTGCGGAGTCCGGAGAGTAACGGAATAGCAGAGAGCTTCGTGAAAACGATAAAGCGTGACTACATCAGTATCATGCCCAAACCAGACGGGTTAACGGCAGCAAAGAACCTTGCAGAGGCGTTCGAGCATTATAACGAATGGCATCCGCATAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1651263‑1651548 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCGGCTTTGTGCACTGTCGCCAGACTCAATCACCAGTTTGTTAGTTTCGGCATGAACAGTTGTGCTCAATGCCAGTGCGCAAGGCAGCAGAATAGCGAGCAGGCCGATTCGTTTGCTGAGAGTGATTTTCATAATTCATTCCCTGTATGAATGATTAAAGGTGATTCTACACCATCCACTGCGGACGCAAAACGTACCAGGAGGGTGTTTATATTGATGATATTATGTCGCCCTATAACTATACATGATGTCAATAAGAGACAAAGATGATTAAAACAACGTTACTATTTTTTGCTAC < NC_000913/1655939‑1655642 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |