New junction evidence | |||||||||||
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CCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACATCCGTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCCGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCC < 2:539698/300‑1 GCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACATCCGTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCCAT < 1:405949/300‑1 AACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACATCCGTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCCATGC < 1:77144/300‑1 GTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACATCCTTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCCATGCCTTCCAGC < 1:248988/300‑1 aatgACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACATCCGTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCCATGCCTTCCAGCAGTGCCA > 1:687822/5‑300 CATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACATCCGTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCCATGCCTTCCAGCAGTGCCA > 1:686653/1‑300 TAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACATCCGTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCNTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTACATGCCTTCCAGCAGTGCCAGT > 2:641502/1‑300 TAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACATCCGTCAATTTCTCATGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTAACGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTACATGCCTTACAGCAGTGCCAGT > 2:4994/1‑300 ACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACATCCGTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCCATGCCTTCCAGCAGTGCCAGTTC < 1:35750/300‑1 CTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACATCCGTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCCATGCCTTCCAGCAGTGCCAGTTCT > 1:645115/1‑300 TGCGTTGACCAATTGAATCTACATCCGTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCCATGCCTTCCAGCAGTGCCAGTTCTTTGC < 2:552130/300‑1 GCGTTGACCAATTGAATCTACATCCGTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCCATGCCTTCCAGCAGTGCCAGTTCTTTGCC > 1:121696/1‑300 ATTGAATCTACATCCGTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCCAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCCATGCCTTCCAGCAGTGCCAGTTCTTTGCCTTCCACTGAA > 1:296231/1‑300 TTGAATNTACATCCTTCACTTTCTCCTGATAGAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTNTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCCATGCCTTCCAGCAGTGCCAGTTCTTTGCCTTCCACTGAAA < 2:710039/300‑1 TTGAATCTACATCCGCCACTTTCTCCTGATAAAGTTCTTGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTAAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCGAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCCATGCCTTCCAGCAGTGCCAGTTCTTTGCCTTCCACTGAAA < 2:657111/300‑1 GAATCTACATCCGTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTAAGGCTGTTTAGCGAGTAGTCAAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTACATGCCTTCCAGCAGTGCAAGTTCTTTGCCTTCCACTGAAATG > 2:128930/1‑300 ATCCGTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCCATGCCTTCCAGCAGTGCCAGTTCTTTGCCTTCCACTGAAATGGTCATTTT > 1:644744/1‑300 GCACGAATGCTCATTTTGGCTGACAAACCAGCTCGTATCTCCTCGCGCTCAGACAGTGTCAGGTGAGCTACAGCCCGCTTACGCTCATGGGGTTTTATGCCGCCAGTATCCCTTAACATAGTGAAGATCGTTCCGGGTTTTGAACCCAGGATATTCGCTATTTCACTGAAGCCTGTTCCGTTCTTCCATAGTTCAAAAACAGAGGCTTTTTCCTCTGCTGTAAATGTTCGTCTCATTCAAAAAACCTCCGCAACCCCATGTTTTCACATAACTGTTGCGTTGACCAATTGAATCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1469593‑1469296 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCGTCACTTTCTCCTGATAAAGTTCGGGGTTGTTGGCAATTTCTGGCTGTGCCAGCAGCGCCTGAGTTTGCGCGTTATATTGCTGGCTAAACTGATGCCAGGCTTCACCATCAATCTGGCCGACTTTTAAAGTCAGCTTGCCGCTGCCCAGATCCTGATTCTGTACCTTCAGGCTGTTTAGCGAGTAATCCAGTTGGCTATTGATCGTTTTACCGTCATTGACCAGATCCGATTTACCGCTGATCTCCATGCCTTCCAGCAGTGCCAGTTCTTTGCCTTCCACTGAAATGGTCATTTT < NC_000913/1690870‑1690572 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |