| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3186096 = | NA (NA) | 24 (0.240) | 21/598 | 3.5 | 16.1% | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 4344206 = | 125 (1.270) | coding (838/1422 nt) | melB | melibiose:H(+)/Na(+)/Li(+) symporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
AGATGTTCACTCTGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGG > NC_000913/4343907‑4344504 | aGATGTTCACTCTGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGNAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAAcc < 2:683417/300‑1 (MQ=255)aGATGTTCACTCTGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAAcc < 1:43039/300‑1 (MQ=255) gATGTTCACTCTGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGTAAGCCATCTGACACTTAAAACCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCt < 2:35515/300‑1 (MQ=255) ttCACTCTGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTg < 1:7800/300‑1 (MQ=255) ctctGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCCTGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGt > 2:324294/1‑300 (MQ=255) ctctGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTNTGGCTCTTGCTTATAATGTAGCAAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTAATCTGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTAGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGt > 2:188042/1‑300 (MQ=255) ctctGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCNAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGt > 1:533142/1‑300 (MQ=255) ctctGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATNCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGNTGACGt > 2:628468/1‑300 (MQ=255) ctctGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGt > 1:251538/1‑300 (MQ=255) ctctGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTAATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGTTAACATGGTGaagt > 2:146277/1‑297 (MQ=255) 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tttCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAAt < 2:649766/300‑1 (MQ=255) cttCAACCATTATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTTAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACAATCAGCTTTCATGCCCCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTACTACCGGCTTTGCGATCTATTATTTCTCATATGTTATCGTTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGTTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAAt < 2:418391/299‑1 (MQ=255) tcatcaCTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTNTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTNTTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTCACCTGGTGACGTTAGTATTCTTACCACGCTTAGTTAAATCATTATccc > 2:619367/1‑300 (MQ=255) 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gtgCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGcc > 1:102257/1‑300 (MQ=255) cAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGc < 1:371992/300‑1 (MQ=255) aCCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGTTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCtg < 1:176376/300‑1 (MQ=255) 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gctAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAg > 1:512556/1‑300 (MQ=255) aaCCTGGTGACGTTAGTATTCTTCACACGCTTAGTTAGATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGc < 1:714685/300‑1 (MQ=255) ccTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCAGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCgg > 2:367960/1‑300 (MQ=255) | AGATGTTCACTCTGGTACTGATCGCCTTTTTTATTGTTTCAACCATCATCACTCTGCGCAATGTGCATGAAGTCTTTTCGTCAGACAATCAACCGTCTGCTGAAGGAAGCCATCTGACACTTAAAGCCATCGTTGCGCTAATTTATAAAAACGATCAGCTTTCATGCCTCTTGGGTATGGCTCTTGCTTATAATGTAGCCAGCAACATTATTACCGGCTTTGCTATCTATTATTTCTCATATGTTATCGGTGATGCGGATTTGTTCCCCTATTATCTGTCGTATGCGGGAGCTGCTAACCTGGTGACGTTAGTATTCTTCCCACGCTTAGTTAAATCATTATCCCGACGCATTTTATGGGCCGGAGCATCTATTCTTCCGGTGTTAAGCTGTGGTGTTCTCCTGTTAATGGCATTAATGAGCTATCACAACGTCGTCCTCATTGTGATTGCGGGTATTTTGCTGAATGTGGGAACGGCGCTTTTCTGGGTATTACAGGTCATCATGGTGGCAGATATCGTTGATTACGGTGAATATAAACTGCACGTACGCTGTGAAAGTATCGCTTACTCCGTGCAGACTATGGTGGTGAAGGGCGG > NC_000913/4343907‑4344504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |