| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 432,120 | IS1 (+) +9 bp | intergenic (‑107/+184) | tsx ← / ← yajI | nucleoside‑specific channel‑forming protein Tsx/putative lipoprotein YajI |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 129 (1.310) | 68/598 | 0.2 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 432120 = | 0 (0.000) | intergenic (‑107/+192) | tsx/yajI | nucleoside‑specific channel‑forming protein Tsx/putative lipoprotein YajI | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 117 (1.180) | 80/598 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 432128 | 0 (0.000) | intergenic (‑115/+184) | tsx/yajI | nucleoside‑specific channel‑forming protein Tsx/putative lipoprotein YajI | |||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
TACTCAAGGTAGGTATCGTTGCGGATCTGCGGTCCGAAACGGGTGTGATAGCTTCCGACAACGTTAACGCTCTGGTGCCACCAGTCGGAAAGATACTGCGGTTTGTCGTTTTCAGCTGCGTTGACAGTAAAAGACGAAGAGAGCGCCAGTACCGCACCGGCTGCCAGTAATGTTTTTTTCATATGTATGCCACTGTTTGAAAATCCCTTGCGGGAGTGAAAAAGGCGCAAATTGCGTTTCTAAATATTTCGTATACAGAGGAGCCTATTATAAAAATCATTGCTCACAAAAATATGTTTCGTTTCACAGTTCTATCATTTACGTAATCGATTGCGTTCACGTTTACACACATTCGGGCGGGGATTGTACTGACTTTCGCCCTTGTTGCAAACTTTTACTATCAATCCAGGTGATGTAAGCAGAGTAACAAAATGACGGGGAAAGATGTTGCGGGACGCACAAAATCGTCCCGAAATACGTTTACTGCATAACAGGTTGAATGTCGTGGATACGTACAAAGCCTAACTGATCCACAGAAATCCCCTTTAACTGTAACGGAATATCAACATCGCTGGGGGCGAGGACGCTGG > NC_000913/431832‑432421 | tACTCAAGGTAGGTATCGTTGCGGATCTGCGGTCCGAAACGGGTGTGATAGCTTCCGACAACGTTAACGCTCTGGTGCCACCAGTCGGAAAGATACTGCGGTTTGTCGTTTTCAGCTGCGTTGACAGTAAAAGACGAAGAGAGCGCCAGTACCGCACCGGCTGCCAGTAATGTTTTTTTCATATGTATGCCACTGTTTGAAAATCCCTTGCGGGAGTGAAAAAGGCGCAAATTGCGTTTCTAAATATTTCGTATACAGAGGAGCCTATTATAAAAATCATTGCTCACAAAAATATGTggt < 1:745793‑M2/300‑4 (MQ=255) cactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagngatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggncggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAAAATATgtttcgt > 2:607490‑M2/287‑300 (MQ=255) cactatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgaaaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAAAATATgtttcgt > 2:346513‑M2/287‑300 (MQ=255) ctatggcgacgctggggcgtcttatgagcctgctgtcaccctttgacgtggtgatatggatgacggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgntatacgcagcgaattgagcggcataanctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccAAAATCTgtttcgttt > 2:529319‑M2/285‑300 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |