| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,315,384 | G→A | Y129Y (TAC→TAT) | yciF ← | DUF892 domain‑containing protein YciF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,315,384 | 0 | G | A | 99.3% | 518.4 / NA | 143 | Y129Y (TAC→TAT) | yciF | DUF892 domain‑containing protein YciF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (64/78); minor base C (1/0); total (65/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
ATGTTGTTCAATACGAGCGCGTAGTTCAGGATAATTATCTATACGGCTGGCCATGGATTCAAGCATAGATTCGGCTTGCTTTTCCATTGCGTGGGCGTCACGTAACCAGTCATGATAATGTTCAATACGATTCATGAAAATGTCCTCTTTATAAAATGACTAAAAGTTAAAATTCATATTTCAGGCTTTATTTTCGGCTTTCTTATTTACGTTATTAATGGCCAGATCAGTCAGTTTGATGTCGGTGGCCTTTTCTTCTTCCAGGGTTTCTTTCAGAAGCTTCGCTGCTTTACGGTAACCTAATTGTTCAGCCAGCGTCGCTAATGTCCCGTAACTGGCAATCTCATAATGCTCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCACGCACTTCGTTTTTCTCGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAAGACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTTTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGATGTTGCTCTTGCG > NC_000913/1315090‑1315678 | aTGTTGTTCAATACGAGCGCGTAGTTCAGGATAATTATCTATACGGCTGGCCATGGATTCAAGCATAGATTCGGCTTGCTTTTCCATTGCGTGGGCGTCACGTAACCAGTCATGATAATGTTCAATACGATTCATGAAAATGTCCTCTTTATAAAATGACTAAAAGTTAAAATTCATATTTCAGGCTTTATTTTCGGCTTTCTTATTTACGTTATTAATGGCCAGATCAGTCAGTTTGATGTCGGTGGCCTTTTCTTCTTCCAGGGTTTCTTTCAGAAGCTTCGCTGCTTTACGATAAcc < 1:705769/300‑1 (MQ=255) 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gctTTACGATAACCTAATTGTTCAGCCAGCGTCGCTAATGTCCCGTAACTGGCAATCTCATAATGCTCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCAAGCACTTCGTTTTTCTAGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAAGACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTTTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGCTGTTACTCtt > 2:321804/1‑300 (MQ=255) ttACGATAACCTAATTGTTCAGCCAGCGTCGCTAATGTCCCGTAACTGGCAATCTCATAATGCTCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCACGCACTTCGTTTTTCTCGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAAGACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTTTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGATGTTGCTCTTGCg < 2:503667/300‑1 (MQ=255) ttACGATAACCTAATTGTTCAGCCAGCGTCGCTAATGTCCCGTAACTGGCAATCTCATAATGCGCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCACGCACTTCGTTTTTCTCGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAAGACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTTTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGATGTTGCTCTTGCg < 2:408486/300‑1 (MQ=255) | ATGTTGTTCAATACGAGCGCGTAGTTCAGGATAATTATCTATACGGCTGGCCATGGATTCAAGCATAGATTCGGCTTGCTTTTCCATTGCGTGGGCGTCACGTAACCAGTCATGATAATGTTCAATACGATTCATGAAAATGTCCTCTTTATAAAATGACTAAAAGTTAAAATTCATATTTCAGGCTTTATTTTCGGCTTTCTTATTTACGTTATTAATGGCCAGATCAGTCAGTTTGATGTCGGTGGCCTTTTCTTCTTCCAGGGTTTCTTTCAGAAGCTTCGCTGCTTTACGGTAACCTAATTGTTCAGCCAGCGTCGCTAATGTCCCGTAACTGGCAATCTCATAATGCTCGACTTTCTGTGCTGCGGCAATCAGTGCGGCATCACGCACTTCGTTTTTCTCGGTACTTTCGATGACCTCATTAGCTTCTTCAATAAGACCTTCCATTGCCACACATTTCATGCGCTTAATTTTCAGGTTCGATTCGGACTCCACAACTTGATCAATACGTTCAATCTGTCCATGAGTTTCCTCGAGGTGCGCATGAAAAGCCTGACTTAATTTTTCATTTGATGTTGCTCTTGCG > NC_000913/1315090‑1315678 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |