| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 509,517 | C→T | E621E (GAG→GAA) | copA ← | Cu(+) exporting P‑type ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 509,517 | 0 | C | T | 98.9% | 287.8 / NA | 87 | E621E (GAG→GAA) | copA | Cu(+) exporting P‑type ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (41/45); total (41/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TCGCCCACCATTGCCACCTGACGTCCTTCACTTTGCAGATGTTTGATCGCTTCGGCTTTACCGTCCGGCAGCACCCCGGCGATCACCTCATCAATCCCTGCTTCTTTGGCGATCGCATTGGCGGTGGTTGGGTTATCCCCGGTCAACATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCTACCGCTTTCCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATCTCCGCTTCGATAGCTTTGGTACCAACCTGTTGCTCATTTAACAGCGCCTGATTGCCCAGCAATAACGCATGACCTTCAGCTTCACCGCTCACGCCCAGCCCGCGCAATGTGCGGAAACCGTTGACCTGCGGTAGCTGCATATCACCTGCTTTATCGAGGATCGCTCGTGCCAGCGGATGGCTGGAACCTTGCTCCAGTGCCGCCGCCAGACGCAATGCCTGCGCTTCATCAACATCAGCAAATGTTTTCACTGCGACAACCTGCGGCTTCCCTTCAGTCAGCGTCCCGGTTT > NC_000913/509221‑509809 | tCGCCCACCATTGCCACCTGACGTCCTTCACTTTGCAGATGTTTGATCGCTTCGGCTTTACCGTCCGGCAGCACCCCGGCGATCACCTCATCAATCCCTGCTTCTTTGGCGATCGCATTGGCGGTGGTTGGGTTATCCCCGGTCAACATCACCAGACGATATCCCGCTTTATGCAGGCGTTGCAGCGCCGCCACGCTATCACTACGCAACGGATCGCGTACTGCCAGCAGGGCTACCGCTTTCCCGTCAACCGCCAGCAGCACAGGCGTTGCCCCTTGCGATGCCTGAGCAGTAATTTcc < 1:107779/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |