| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,540,703 | G→A | E99E (GAG→GAA) | feoB → | Fe(2(+)) transporter FeoB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,540,703 | 0 | G | A | 99.1% | 392.2 / NA | 110 | E99E (GAG→GAA) | feoB | Fe(2(+)) transporter FeoB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (47/62); minor base C (0/1); total (47/63) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TTAACCATTGGCTTAATTGGTAATCCAAATTCTGGCAAGACAACGTTATTTAACCAGCTCACTGGCTCACGTCAGCGTGTAGGTAACTGGGCTGGCGTTACCGTCGAACGTAAAGAAGGGCAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATTGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGACAT > NC_000913/3540416‑3540993 | ttAACCATTGGCTTAATTGGTAATCCAAATTCTGGCAAGACAACGTTATTTAACCAGCTCACTGGCTCACGTCAGCGTGTAGGTAACTGGGCTGGCGTTACCGTCGAACGTAAAGAAGGGCAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAACGTAACCTGTAc < 1:350121/300‑1 (MQ=255) 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gTCTAACCTTGAACGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATTGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGa > 1:132532/1‑300 (MQ=255) gTCTAACCTTGAACGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATTGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGa > 2:521027/1‑300 (MQ=255) gTCTAACCTTGAACGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATTGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCAGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGa > 2:409632/1‑300 (MQ=255) 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TTAACCATTGGCTTAATTGGTAATCCAAATTCTGGCAAGACAACGTTATTTAACCAGCTCACTGGCTCACGTCAGCGTGTAGGTAACTGGGCTGGCGTTACCGTCGAACGTAAAGAAGGGCAATTCTCCACCACCGATCATCAGGTCACGCTGGTGGACCTGCCCGGCACCTATTCTCTGACCACCATCTCATCGCAGACCTCGCTCGATGAGCAAATCGCCTGTCACTACATTTTGAGTGGCGACGCCGACCTGCTGATTAACGTGGTGGATGCGTCTAACCTTGAGCGTAACCTGTACCTGACGCTACAACTGCTGGAACTCGGCATTCCCTGCATTGTGGCACTGAACATGCTCGACATTGCCGAGAAGCAAAATATTCGTATTGAAATTGATGCTCTGTCGGCGCGTCTGGGCTGTCCGGTGATCCCGCTGGTTTCAACCCGTGGTCGCGGTATTGAAGCGCTCAAGCTGGCGATTGATCGCTATAAAGCTAACGAGAATGTGGAACTGGTGCATTACGCACAGCCGCTGCTCAACGAAGCAGATTCACTGGCAAAAGTGATGCCTTCCGACAT > NC_000913/3540416‑3540993 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |