| New junction evidence | |||||||||||
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aaTTATNGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTNCAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAGTGTTACGTTGAGAAAAATGAACTGGTTGCGTAATTTTCATCCGTAACGGATTAAAGGTAACCAGTTATTTTTGCTGGCGATTAAAGAATAATCGTTCGATTACCGTAAACAAAGACGCGCTGTGCCAGTAc < 2:663466/300‑1 (MQ=255) aaTTATGGTGGTGGTGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTGTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAGTGTTACGTTGATAAAAATGAACTGGTTGCGTAATTTTCATCCTTAACGGATTAAAGGTAACCAGTTATTTTTGCTGGCGATTAAAGAATAATCGTTCGATTACCGTAAACAAAGACGCGCTGTGCCAGTAc < 2:274343/300‑1 (MQ=255) aaTTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAGTGTTACGTTGAGAAAAATGAACTGGTTGCGTAATTTTCATCCGTAACGGATTAAAGGTAACCAGTTATTTTTGCTGGCGATTAAAGAATAATCGTTCGATTACCGTAAACAAAGACGCGCTGTGCCAGTAc < 1:381108/300‑1 (MQ=255) tggtgttggGTGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTTGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAGTGTTACGTTGAGAAAAATGAACTGGTTGCGTAATTTTCATCCGTAACGGATTAAAGGTAACCAGTTATTTTTGCTGGCGATTAAAGAATAATCGTTCGATTACCGTAAACAAAGACGCGCTGTGCCAGTACTTTGt < 1:489310/300‑1 (MQ=255) gtggtggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGTTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAGTGTTACGTTGAGAAAAATGAACTGGTTGCGTAATTTTCATCCGTAACGGATTAAAGGTAACCAGTTATTTTTGCTGGCGATTAAAGAATAATCGTTCGATTACCGTAAACAAAGACGCGCTGTGCCAGTACTTTGtat < 1:444693/300‑1 (MQ=255) gtggtggGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAGTGTTACGTTGAGAAAAATGAACTGGTTGCGTAATTTTCATCCGTAACGGATTAAAGGTAACCAGTTATTTTTGCTGGCGATTAAAGAATAATCGTTCGATTACCGTAAACAAAGACGCGCTGTGCCAGTACTTTGtat > 1:88588/1‑300 (MQ=255) 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cGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCACTGTAAAGTGTTACGTTGAGAAAAATGAACTGGTTGCGTAATTTTCATCCGTAACGGATTAAAGGTAACCAGTTATTTTTGCTTGCGATTAAAGAATAATCGGTCGATTACCGTAAACAAAGACGCGCTGTGCCAGTACTTTGTATAGTGCACGACTTAAGAc < 2:287516/300‑1 (MQ=255) | GATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGG‑‑TAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGATTATTCGTCGCTTCGCTCCTCACCCTTCGGGCCGTTGCCTGTGGCAACGTTCTCTCGCTTTCGCTCGAATCGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCACCCTTCCCCGATGAGTGCAAACTTTCACAATCTCACCGAAGTTACCACATCGCTGTGGTGAATTATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCACGGGGTAATGCTTTTTACTGGCCTGCTCCCTTATCGGGAAGCGGGGCGCATCATATCAAATGACGCGCCGCTGTAAAGTGTTACGTTGAGAAAAATGAACTGGTTGCGTAATTTTCATCCGTAACGGATTAAAGGTAACCAGTTATTTTTGCTGGCGATTAAAGAATAATCGTTCGATTACCGTAAACAAAGACGCGCTGTGCCAGTACTTTGTATAGTGCACGACTTAAGAC > NC_000913/1287259‑1287856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |