| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,234,887 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑170/‑47) | nhaB ← / → fadR | Na(+):H(+) antiporter NhaB/DNA‑binding transcriptional dual regulator FadR |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 1234887 = | 0 (0.000) | 136 (1.300) | 74/598 | 0.1 | 100% | intergenic (‑170/‑51) | nhaB/fadR | Na(+):H(+) antiporter NhaB/DNA‑binding transcriptional dual regulator FadR |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1234891 | 0 (0.000) | 100 (0.960) | 55/598 | 0.5 | 100% | intergenic (‑174/‑47) | nhaB/fadR | Na(+):H(+) antiporter NhaB/DNA‑binding transcriptional dual regulator FadR |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
CCGCGACGAAAGGGCTGATGAGGAAAATTAACGGGTTTACGATTAAGAAAATGATGAGGGCGAGTTTGTACCAGTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCCAGGAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGGTATGATGAGTCCAACTTTGTTTTGCTGTGTTATGGAAATCTCACTATGGTCATTAAGGCGCAAAGCCCGGCGGGTTTCGCGGAAGAGTACATTATTGAAAGTATCTGGAATAACCGCTTCCCTCCCGGGACTATTTTGCCCGCAGAACGTGAACTTTCAGAATTAATTGGCGTAACGCGTACTACGTTACGTGAAGTGTTACAGCGTCTGGCACGAGATGGCTGGTTGACCATTCAACATGGCAAGCCGACGAAGGTGAATAATTTCTGGGAAACTTCCGGTTTAAATATCCT > NC_000913/1234588‑1235185 | ccgcgactaaagtgccgactaGGAAAATTAACGGGTTTACGATTAAGAAAATGATGAGGGCGAGTTTGTACCAGTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCCATGAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGccc < 2:14141/280‑1 (MQ=255) actaaagggCTGATGAGGAAAATTAACGGGTTTACGATTAAGAAAATGATGAGGGCGAGTTTGTACCAGTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCCAGGAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGt < 1:627640‑M1/297‑2 (MQ=255) acgccagttcgcccggatgttgggacttgaaccgaagaacacggcggtgcggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgatgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataaccgatgtctggaaatataggggcaaatccaCTCTgg < 1:804408‑M1/6‑1 (MQ=255) aCGAAAGGGCTGATGAGGAAAATTAACGGGTTTACGATTAAGAAAATGGTGAGGGCGAGTTTGTACCAGTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGNGGCCCCAGGAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAAGAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGt < 2:704917‑M1/300‑2 (MQ=255) cgccagttcgcccggatgttgggacttgaaccgaagaacacggcggtgcggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCTCTGGt < 1:654900‑M1/7‑1 (MQ=255) gAAAGGGCTGATGATGAAAATTAACGGGTTTACGATTAAGAAAATGATTAGGGCGAGTTTGTACCAGTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCNAGGAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGtag < 1:557591‑M1/300‑4 (MQ=255) gAAAGGGCTGATGAGGAAAATTAACGGGTTTACGATTAAGAAAATGATGAGGGCGAGTTTGTACCAGTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCCAGGAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGtag < 1:436867‑M1/300‑4 (MQ=255) aaGGGCTGATGAGGAAAATTAACGGGTTTACGATTAAGAAAATGATGAGGGCGAGTTTGTACCAGTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCCAGGAGNTCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAANGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGtagac < 2:653680‑M1/300‑6 (MQ=255) aaGGGCNGATGAGGAAAATTAACGGGTTTACGATTAAGAAAATGATGAGGGCGANTTTGTACCAGTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCCAGGAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGCCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGtagac < 2:671118‑M1/300‑6 (MQ=255) agttcgcccggatgttgggacttgaaccgaagaacacggcggtgcggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCTCTGGTatga > 1:722766‑M1/290‑300 (MQ=255) 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aGGGCTGATGAGGAAAATTAACGGGTTTACGATTAAGAAAATGATGAGGGCTAGTTTGTACCAGTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCCAGGAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGtagact < 2:21725‑M1/300‑7 (MQ=255) aGGGCTGATGAGGAAAATTAACGGGTTTACGATTAAGAAAATGATGAGGGCGAGTTTGTACCAGTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCCAGGAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGtagact < 1:101252‑M1/300‑7 (MQ=255) aGGGCTGATGAGGAAAATTAACGGGTTTACGATTAAGAAAAGGATGAGGGCGAGTTTGTACCAGTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCCAGGAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGtagact < 2:679257‑M1/300‑7 (MQ=255) cTGATGAGGAAAATCAACGGGTTTGAGAGTAAGAAAATGATGAGTGCGAGTTTGTACCAGTCTGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCCAGGAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGtagactggcc < 2:761567‑M1/300‑11 (MQ=255) tAACGGGTTTACGATTAAGAAAATGATGAGGGCGAGTTTGTACCATTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCCAGTAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGtagactggccccctgaatctccag < 2:256879‑M1/300‑25 (MQ=255) tgaaccgaagaacacggcggtgcggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCTCTGGTATGATGAGTCCAACTTTGTTTTGCtg > 1:768122‑M1/268‑300 (MQ=255) 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gtgcggagtccggagagtaacggaatagcagagagcttcgtgaaaacgataaagcgtgactacatcagtatcatgcccaaaccagacgggttaacggcagcaaagaaccttgcagaggcgttcgagcattataacgaatggcatccgcatagtgcgctgggttatcgctcgccacgggaatatctgcggcagcgggcttgtaatgggttaagtgataacagatgtctggaaatataggggcaaatccaCTCTGGTATGATGAGTCCAACTTTGTTTTGCTGTGTTATGGAAATCTCACTa > 1:450503‑M1/249‑300 (MQ=255) atgaGGGCGAGTTTGTACCAGTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCCAGGAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtg < 1:638846‑M1/300‑50 (MQ=255) gaGGGCGAGTTTGTACCAGTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCCAGGAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGtagactggccccctgaatctccagacaaccaatatcacttaaataagtgat < 2:371830‑M1/300‑52 (MQ=255) 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CCGCGACGAAAGGGCTGATGAGGAAAATTAACGGGTTTACGATTAAGAAAATGATGAGGGCGAGTTTGTACCAGTCGGGGGACTGGCCCAAAAAATTGCGCCATAGCGCGCGGCCCCAGGAGATCTCCATGATGGTTTCCCTTACCTTACAAATAATCAATGATGTTTTTATGTTTAAACGCAAAGCTTAACGGTCAGGCAGGAGTGAGGCAAGTCTTGATAGTCAAGGGGAAAGAGATGCGGAAAATGAAGCCTTGATCCCTTTTTCTTCTTTTTGTCTGCTATCAGCGTAGTTAGCCCTCTGGTATGATGAGTCCAACTTTGTTTTGCTGTGTTATGGAAATCTCACTATGGTCATTAAGGCGCAAAGCCCGGCGGGTTTCGCGGAAGAGTACATTATTGAAAGTATCTGGAATAACCGCTTCCCTCCCGGGACTATTTTGCCCGCAGAACGTGAACTTTCAGAATTAATTGGCGTAACGCGTACTACGTTACGTGAAGTGTTACAGCGTCTGGCACGAGATGGCTGGTTGACCATTCAACATGGCAAGCCGACGAAGGTGAATAATTTCTGGGAAACTTCCGGTTTAAATATCCT > NC_000913/1234588‑1235185 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |