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Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
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TCTTATACTTATACCGTAATGCTAAAAGCAGTACAGCCAGCCCAGCGTAGATGAGCGGCTGCGGTGAAATAATCTTCACGGACCACAGATAATGTATTGGGGCCAGAATCGCGACAAGATAGACGAAATTATGCAACTGTTGCCAGTGCTTGCCGAGTTTTCGCTGCATCGCCTGGGTTGAAGTGAACGCTAAAGCAAGCAAAATTACCCAGCTGATAATACCTAACGTTAAATAATGCCGGGTAATTAACTCCTTACCTAATAACGCCAGATTATTCACGCCCAGCTCCAGCAATGCGT < 2:42058/300‑1 TATACTTATACCGTAAGGCTAAAAGCAGTACAGCCAGCCCAGCGTAGATGAGCGGCTGCGGTGAAATAATCTTCACGGACCACAGATAATGTATTGGGGCCAGAATCGCGACAAGATAGACGAAATTATGCAACTGTTGCCAGTGCTTGCCGAGTTTTCGCTGCATCGCCTGGGTTGAAGTGAACGCTAAAGCAAGCAAAATTACCCAGCTGATAATACCTAACGTTAAATAAGGCCGGGTAATTAACTCCTTACCTAATAACGCCAGATTATTCACGCCCAGCTCCAGCAATGCGTAAC < 2:525100/300‑1 TACTTATACCGTAAGGCTAAAAGCAGTACAGCCAGCCCAGCGTAGATGAGCGGCTGCGGTGAAATAATCTTCACGGACCACAGATAATGTATTGGGGCCAGAATCGCGACAAGATAGACGAAATTATGCAACTGTTGCCAGTGCTTGCCGAGTTTTCGCTGCATCGCCTGGGTTGAAGTGAACGCTAAAGCAAGCAAAATTACCCAGCTGATAATACCTAACGTTAAATAAGGCCGGGTAATTAACTCCTTACCTAATAACGCCAGCTTATTCACGCCCAGCTCCAGCAATGCGTAACTT > 2:612924/1‑300 GATGTGTAATGTTATATTGTAACATATAGCAAAATGCAACAACTCTTAGGAAACGAGAGCATGGCTTTCTCAGTTCTACTTATCTATCTTATTGAAATAAAATAAATTATTTTGGTGATTTGAGGTTGATGACAAACGAAACATAACCTGATGCGATCTGTGTATGCCGGATAGGGCGCTCGCGCCACATCCGGCAGGGATAACGCGTACTTTGTCGGCAATATGAAGTTATACAGATAATTTGTTGTGAACCTGCTTGCGTAACCGGTTAAAAAGGGAACGCAACTTCTTATAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2041346‑2041052 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTTATACCGTAAGGCTAAAAGCAGTACAGCCAGCCCAGCGTAGATGAGCGGCTGCGGTGAAATAATCTTCACGGACCACAGATAATGTATTGGGGCCAGAATCGCGACAAGATAGACGAAATTATGCAACTGTTGCCAGTGCTTGCCGAGTTTTCGCTGCATCGCCTGGGTTGAAGTGAACGCTAAAGCAAGCAAAATTACCCAGCTGATAATACCTAACGTTAAATAAGGCCGGGTAATTAACTCCTTACCTAATAACGCCAGATTATTCACGCCCAGCTCCAGCAATGCGTAACTT < NC_000913/2041057‑2040761 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |