Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 4,380,292 | 2 bp→A | coding (225‑226/735 nt) | frdB ← | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,380,292 | 0 | G | . | 98.2% | 555.8 / 3.3 | 112 | coding (226/735 nt) | frdB | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
* | NC_000913 | 4,380,293 | 0 | T | A | 100.0% | 399.7 / NA | 112 | K75N (AAA→AAT) | frdB | fumarate reductase iron‑sulfur protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (61/51); total (61/51) |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CAGCCGGACCGATGAACTCTGGGTTCAGGCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCAGTTTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCAC > NC_000913/4380001‑4380574 | cAGCCGGACCGATGAACTCTGGGTTCAGGCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAGAACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTATAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCAc < 1:674561/300‑1 (MQ=255) 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ccTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAANTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTNCTTcca > 2:604385/1‑299 (MQ=255) ttCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGNTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTNTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGcc > 2:686747/1‑300 (MQ=255) ttCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTNGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAAGGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAANTTTCAGGTTTCTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATCGGCTGCTTCCGcc < 2:692285/300‑1 (MQ=255) ccGTCGGTGTAATCACGCATGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCg < 2:672131/300‑1 (MQ=255) gtgtAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATACCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCNTCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCa > 2:545702/1‑300 (MQ=255) gtAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATc < 1:418830/300‑1 (MQ=255) cAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGcc < 1:392462/300‑1 (MQ=255) cAGGAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGcc > 2:660785/1‑300 (MQ=255) ggAAGGTTTTACATGCCA‑ATTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCAc > 1:701430/1‑300 (MQ=255) | CAGCCGGACCGATGAACTCTGGGTTCAGGCCAAACTGCGGGCACGCGGCGTAGCACAAACCACAGTTGATGCAACCGGAGAACTGGTGATACTTCGCCATCTGCGCCGGGGTCTGGATGTTAGTACCCTGATCCGCGGTGCGGGAGTTGCCGATGATGTACGGTTTGATCGCTTCCAGACTTTCGATGAAGTGGGTCATATCGACCACCAGATCGCGTTCAATCGGGAAGTTAGCTAACGCTTCAACCTTCATACCGTCGGTGTAATCACGCAGGAAGGTTTTACATGCCAGTTTTGGCACGTTGTTAACCATCATGCCGCAGGAACCACAAATCGCCATACGGCAGGACCAGCGGTAGCTCAGGTCCGGTGCCAGGTTGTCTTTGATGTAGCCCAGCGCATCCAGTAATGAGGTAGTTGCGTCATAAGGCACTTCATAGAATGCGCTATGCGGTGCGGTATCGACTTCCGGGTTATAGCGCACCACCTCAATTTTCAGGTTTTTCATCTCAGCCATTCGCCTTCTCCTTCTTATTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCAC > NC_000913/4380001‑4380574 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |