| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3270072 = | 73 (0.770) | 5 (0.050) +CAGATTGTTG |
5/578 | 5.4 | 5.7% | intergenic (+470/+144) | yhaC/rnpB | uncharacterized protein YhaC/RNase P catalytic RNA component |
| ? | NC_000913 | 3639193 = | 98 (1.030) | intergenic (+52/+192) | pitA/uspB | metal phosphate:H(+) symporter PitA/universal stress protein B | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAATTCAATAGATTGCAGAGATTATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGCATCAGGCAATTTTGCGTTTGTAATCAGTCTCGAGCGGGTCAGTTTACTGGCCCGCTTTTTTTATGCGTTATTATTGCTGAAGTGCTTAATGCCAAATCATCAATGCAATCAGGCTGACCACCACCAGACCACACAATGCGCTGGTCAGAATAAACTGCCGACGCACCCGCTCACAGCGGCGAATAAATTCA > NC_000913/3638895‑3639490 | gACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTCCCGGCCCGGCGAGTTCTCCCAGGATGCCGGTTTCCCCTCCTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCAGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTTACCCGCATTCGGATGGCCTTGGTGTTTCCCCTTCCGGCTGCGGTCCTGCTTTCCGGCGGGCTGTCCTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTNATCGTCAGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCAGCTTCAGATTGTGACATAg > 2:544922/1‑300 (MQ=255)gACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGNTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAANCCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTGCGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAg > 2:483275/1‑300 (MQ=255)gACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAg > 1:248683/1‑300 (MQ=255)gACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCAGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACACACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTTTGACATAg > 2:447000/1‑300 (MQ=255)gACCGACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCTGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAg < 1:49758/300‑1 (MQ=255) aCCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGANGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGNAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCATGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGt > 2:520551/1‑300 (MQ=255) ccTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGCGACATAGTg > 2:122976/1‑300 (MQ=255) aCGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTAGACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTgcgc < 1:554518/300‑1 (MQ=255) gCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGACCTGGGTGTTTACCCTTCCAGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCtt > 1:221390/1‑300 (MQ=255) tGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGcc < 1:568763/300‑1 (MQ=255) tGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCATCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGACCCGATTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGcc > 2:333128/1‑300 (MQ=255) gCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATg > 2:127450/1‑300 (MQ=255) gCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATg > 1:588208/1‑300 (MQ=255) gtgtCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATc > 1:462613/1‑300 (MQ=255) gtgtCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCACTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGGACGCCCTATc > 2:373975/1‑300 (MQ=255) gtgtCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTAAGCTGGCCCGCTTCAGATCGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATc > 2:373944/1‑300 (MQ=255) gtgtCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCANTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCNGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATc > 2:492053/1‑300 (MQ=255) tgtCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCTGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATcc < 1:706875/300‑1 (MQ=255) ggCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTAcc > 1:719155/1‑299 (MQ=255) ccTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTGCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACaaa < 1:38436/300‑1 (MQ=255) tGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACaaaaa < 1:329196/300‑1 (MQ=255) gTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCANGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGAGGACTATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTCCAGCGTCAAACCGTGACCAGCCTTCTGATGGCCTGAGTTTTNACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGTTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCCGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACCTAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGCCCGCCTTATCCGGCCTACAAAAGCATGCa > 2:512449/1‑300 (MQ=255) gTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCa > 1:399896/1‑300 (MQ=255) ttATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCaa > 1:255372/1‑300 (MQ=255) ttCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAATTCAATAGATTGCagag > 1:416900/1‑300 (MQ=255) ccACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAATTCAATAGATTGCAGAGAt > 1:24683/1‑300 (MQ=255) actCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAATTCAATAGATTGCAGAGATTATGt < 1:636452/300‑1 (MQ=255) actCACGTACTCGCCTCTTCTGTCGCGTGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCTGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAANACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAANATGCAAATTCAATAGATTGCAGAGATTATGt < 2:518005/300‑1 (MQ=255) acccACGTACCCTCCTCTTCTTCCGCGGGGACGATGGGGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAATTCAATAGATTGCAGAGATTaggt < 1:107614/297‑4 (MQ=255) cACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAATTCAATAGATTGCAGAGGTTATGTAgg > 1:187902/1‑300 (MQ=255) cACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAATTCAATAGATTGCAGAGATTATGTAgg > 1:406314/1‑300 (MQ=255) cGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAATTCAATAGATTGCAGAGATTATGTAGGcc < 1:96702/300‑1 (MQ=255) cGTACTCTCCTCCTCTGTCGCGTGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCTGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAATTCAATAGATTGCAGAGATTATGTAGGcc < 2:198048/300‑1 (MQ=255) gTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTAAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAATTCAATAGACTGCAGAGATTATGTAGGCCt > 2:381553/1‑300 (MQ=255) tctcCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATTGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAATTCAATAGATTGCAGAGATTATGTAGGCCTGATa < 2:562372/300‑1 (MQ=255) ctcctcTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAATTCAATAGATTGCAGAGATTATGTAGGCCTGATaa > 1:678075/1‑300 (MQ=255) gTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAAGTCAATAGATTGCAGAGATTATGTAGGCCTGATAAACGTAGCGCa > 2:344975/1‑300 (MQ=255) 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aTAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAATTCAATAGATTGCAGAGATTATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGCATCAGGCAATTTTGCGTTTGTAATCAGTCTCGAGCGGGTCAGTTTACTGGCCCGCTTTTTTTATGCGTTATTATTGCTGAAGTGCTTAATGCCAAATCATCAATGCAATCAGGCTGACCACCACCAGACCACACAATGCGCTGGTCAGAATAAACTGCCGACGCACCCGCTCACAGCGGCGAATAAATtca > 1:563650/1‑300 (MQ=255) | GACCTACGCTCAGGGGATGTCTGCCCAGATGACGGCGGCAGTGTCTATCGGCCTGGCGAGTTATACCGGGATGCCGGTTTCCACTACTCACGTACTCTCCTCTTCTGTCGCGGGGACGATGGTGGTAGATGGTGGCGGCTTACAGCGTAAAACCGTGACCAGCATTCTGATGGCCTGGGTGTTTACCCTTCCGGCTGCGGTACTGCTTTCCGGCGGGCTGTACTGGCTCTCCTTGCAGTTCCTGTAATCGTACGCACCAAAACGAGCGGGTCAGCTGGCCCGCTTCAGATTGTGACATAGTGCGCTTTGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAACATGCAAATTCAATAGATTGCAGAGATTATGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGCATCAGGCAATTTTGCGTTTGTAATCAGTCTCGAGCGGGTCAGTTTACTGGCCCGCTTTTTTTATGCGTTATTATTGCTGAAGTGCTTAATGCCAAATCATCAATGCAATCAGGCTGACCACCACCAGACCACACAATGCGCTGGTCAGAATAAACTGCCGACGCACCCGCTCACAGCGGCGAATAAATTCA > NC_000913/3638895‑3639490 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |