| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 361,489 | G→A | N124N (AAC→AAT) | lacA ← | galactoside O‑acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 361,489 | 0 | G | A | 98.6% | 482.8 / NA | 140 | N124N (AAC→AAT) | lacA | galactoside O‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base A (52/86); total (52/88) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.30e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
ACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCGTTATCGGAAAAGAGTACATCTCGCCGTTTTTTCTCAATTCATGGTGTACAGGGTGTCCCGTAACGGAAAGAGTAACGTTGGGTGCAATCAGTACGTTATCACCGATTGTTACCGTGTAGTCATCGACAATGGTTAAATTGAAATTTGCATAAAAATTGCGGCCTATATGGATGTTGGAACCGTAAGAGAAATAGACAGGCGGTTCTACCCAGGCGTTTTCCCCTACCGTGGCAAACATTTCTTTAATCAGGCTTTCTCT‑TTTTTCAACTTCTGATGGATGCGAGTGATTAAACTCATACATTAACGTTTTCCCAC > NC_000913/361204‑361778 | ttGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCGGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCGTTATCGGAAAAGAGTACATCTAGCCATTTTTTCTCAATTCAt > 2:413421/1‑300 (MQ=255) 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tctaggagacgattacttctcGCCGTTTTTGCTCAATTCATGGTGTACAGGGTGTCCCGTAACGGAACCATTACCGTGGGGTGCAGTCAGGACGCGATCACCGATTGGTCCCGTGCAGTCATAGACAATGGTTAACTCGAAATTTGCAGAAGAATTGCGGCCGATATGGATGTCGGAACCGTGATAGAAGTAGGTAGGTGGGTCTACCCATGCGTTTTTACCTACTGTGGCAAACGGTTCTGTAAGCACGCTGTC‑CTCTTTTTCGACGTATGACGGATGCGATTGATTAAACTCAGACAt < 2:111690/283‑1 (MQ=255) tATCGGAAAAGAGTACATCTCGCCATTTTTTCTCAATTCATGGTGTACAGGGTGTCCCGTAACGGAAAGAGTAACGTTGGGTGCAATCAGTACGTTATCACCGATTGTTACCGTGTAGTCATCGACAATGGTTAAATTGAAATTTGCATAAAAATTGCGGCCTATATGGATGTTGGAACCGTAAGAGAAATAGACAGGCGGTTCTACCCAGGCGTTTTCCCCTACCGTGGCAAACATTTCTTTAATCAGGCTTTCTCT‑TTTTTCAACTTCTGATGGATGCGAGTGATTAAACTCATACAt < 1:367601/300‑1 (MQ=255) aaaaGAGTACATCTCGCCATTTTTTCTCAATTCATGGTGTACAGGGTGTCCCGTAACGGAAAGAGTAACGTTGGGTGCAATCAGTACGTTATCACCGATTGTGACCGTGTAGTCATCGACAATGGTTAAATTGAAATTTGCATAAAAATTGCGGCCTATATGGATGTTGGAACCGTAAGAGAAATAGACAGGCGGTTCTACCCAGGCGTTTTCCCCTACCGTGGCAAACATTTCTTTAATCAGGCTTTCTCT‑TTTTTCAACTTCTGATGGATGCGAGTGATTAAACTCATACATTAACGt < 1:776897/300‑1 (MQ=255) gagTACATCTCGCCATTTTTTCTCAATTCATGGTGTCCAGGGTGTCCCGTAACGGAAAGAGTAACGTTGGGTGCAATCAGTACGTTATCACCGATTGTTACCGTGTAGTCATCGACCATGATTACATTGAAATTTGCATAAAAATTGCGGCCTATATGGATGTTGGAACCGTAAGAGAAATAGACAGGCGGTTCTACCCAGGCGTTTTCCCCTACAGTGGCAAACATTTCTTTAATCAGGATTTCTCT‑TTTTTCACCTTCTGATGGATGCGAATGATTAAAccctcacagtaatgttttc > 2:177224/1‑282 (MQ=255) gagTACATCTCGCCATTTTTTCTCAATTCATGGTGTACAGGGTGTCCCGTAACGGAAAGAGTAACGTTGGGTGCAATCAGTACGTTATCACCGATTGTTACCGTGTAGTCATCGACAATGGTTAAATTGAAATTTGCATAAAAATTGCGGCCTATATGGATGTTGGAACCGTAAGAGAAATAGACAGGCGGTTCTACCCAGGCGTTTTCCCCTACCGTGGCAAACATTTCTTTAATCAGGCTTTCTCT‑TTTTTCAACTTCTGATGGATGCGAGTGATTAAACTCATACATTAACGTTTTc > 1:798790/1‑300 (MQ=255) acacctcGCCATTTCTTCTCAATTCATGGTGTACAGGGTGTCCCGTAACGGAAAGAGTAACGTTGGGTGCAATCAGTACGTTATCACCGATTGTTACCGTGTAGTCATCGACAATGGTTAAATTGAAATTTGCATAAAAATTGCGGCCTATATGGATGTTGGAACCGTAAGAGAAATAGACAGGCGGTTCTACCCAGGCGTTTTCCCCTACCGTGGCAAACATTTCTTTAATCAGGCTTTCTCT‑TTTTTCAACTTCTGATGGATGCGAGTGATTAAACTCATACATTAACGTTTTCCCAc < 2:75647/296‑1 (MQ=255) | ACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGAATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCGTTATCGGAAAAGAGTACATCTCGCCGTTTTTTCTCAATTCATGGTGTACAGGGTGTCCCGTAACGGAAAGAGTAACGTTGGGTGCAATCAGTACGTTATCACCGATTGTTACCGTGTAGTCATCGACAATGGTTAAATTGAAATTTGCATAAAAATTGCGGCCTATATGGATGTTGGAACCGTAAGAGAAATAGACAGGCGGTTCTACCCAGGCGTTTTCCCCTACCGTGGCAAACATTTCTTTAATCAGGCTTTCTCT‑TTTTTCAACTTCTGATGGATGCGAGTGATTAAACTCATACATTAACGTTTTCCCAC > NC_000913/361204‑361778 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |