| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 339,376 | G→A | G351E (GGG→GAG) | yahG → | DUF1116 domain‑containing protein YahG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 339,376 | 0 | G | A | 96.9% | 213.0 / NA | 64 | G351E (GGG→GAG) | yahG | DUF1116 domain‑containing protein YahG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (37/25); minor base C (2/0); total (39/25) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTCAGGCGCTGACGCCGGGGATTATTCAGGCGGGTTATTCCGTCGAGCAACAGCGCGAAGTGTTTGAGTTTGTCGCCAGCAGCGACTACTTCTCCGGCCCGACGTGGATGGCGATGTGTAAAGCGGCGATGGATGCGGCGCATGGCATCGAATACAGCACCGTGGTCACCACCATGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGGGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCATCGCCCATAAAGATGCGGGCGTCGGCATGATTGGC > NC_000913/339082‑339668 | ttCAGGCGCTGACGCCGGGGATTATTCAGGCGGGTTATTCCGTCGAGCAACAGCGCGAAGTGTTTGAGTTTGTCGCCAGCAGCGACTACTTCTCCGGCCCGACGTGGATGGCGATGTGTAAAGCGGCGATGGATGCGGCGCATGGCATCGAATACAGCACCGTGGTCACCACCATGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCAAGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTgg > 2:132759/1‑300 (MQ=255) ggTTCTTCCGTCGAGCAACCGCGCGCCGTGTTTGCGTTTGTCGCCAGCAGCGACTACTTCTCCGGCCCGACGTGGATGGCGATGTGTAAAGCGGCGATGGATGCGGCGCATGGCATCGAATACAGCACCGTGGTCGCCACCATGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCACGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGGTTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCACCATCACCG‑AAACCTAc > 1:30978/1‑300 (MQ=255) tCGAGCAACAGCGCGAAGTGTTTGAGTTTGTCGCCAGCAGCGACTACTTCTCCGGCCCGACGTGGATGGCGATGTGTAAAGCGGCGATGGATGCGGCGCATGGCATCGAATACAGCACCGTGGTCACCACCATGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCg < 1:406006/300‑1 (MQ=255) gAGCAACAGCGCGAAGTGTTTGAGTTTGTCGCCAGCAGCGACTACTTCTCCGGCCCGACGTGGATGGCGATGTGTAAAGCGGCGATGGATGCGGCGCATGGCATCGAATACAGCACCGTGGTCACCACCATGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGa > 2:711688/1‑300 (MQ=255) gtgtTTGAGTTTGTCGCCAGCAGCGACTACTTCTCCGGCCCGACGTGGATGGCGATGTGTCAAGCGGCGATGGATGCGGCGCATGGCATCGAATACAGCACCGTGGTCACCACCATGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGAcc > 2:811067/1‑300 (MQ=255) gtgtTTGAGTTTGTCGCCAGCAGCGACTACTTCTCCGGCCCGACGTGGATGGCGATGTGTACAGCGGCGATGGCTACGGCGCATGGCATCGAATACAGCACCGTGGCCACCACCATGGCGCGTAACGGCATCGAGTTTGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGGTCGGCACGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGCGCTGGATATCGGCGACAGCGTCATCAACGCAAAAC‑AAGGTATTGGCGGATTTGCTATAGCGAcc > 2:60898/1‑300 (MQ=255) gtgtTTGAGTTTGTCGCCAGCAGCGACTACTTCTCCGGCCCGACGTGGATGGCGATGTGTAAAGCGGCGATGGATGCGGCGCATGGCATCGAATACAGCACCGTGGTCACCACCATGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGCTATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAAACTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGAcc > 2:60811/1‑300 (MQ=255) ttGTCGCCAGCAGCGACTACTTCTCCGGCCCGACGTGGATGGCGATGTGTAAAGCGGCGATGGATGCGGCGCATGGCATCGAATACAGCACCGTGGTCACCACCATGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTa < 1:817206/300‑1 (MQ=255) gCCCGACGTGGATGGCGATGTGTAAAGCGGCGATGGATGCGGCGCATGGCATCGAATACAGCACCGTGGTCACCACCATGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGTGCAATNGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGTCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTgg < 2:215087/300‑1 (MQ=255) gACGTGGATGGCGATGTGTAAAGCGGCGATGGATGCGGCGCATGGCATCGAATACAGCACCGTGGTCACCACCATGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGgaaga > 1:186219/1‑300 (MQ=255) 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gcgATGGATGCGGCGCATGGCATCGAATACAGCACCGTGGTCACCACCATGGCGCGTAACGGCGGCGAGTTCGGCCTGCGGGTCATCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGNTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGNTATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATg < 2:574200/300‑1 (MQ=255) gcgcATGGCATCGAATACAGCACCGTGGTCACCACCATGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCAcc > 1:335727/1‑300 (MQ=255) gCATCGAATACAGCACCGTGGTCACCACCATGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTg > 2:828795/1‑300 (MQ=255) 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ccaccaTGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCATGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGTGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGAGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAAAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATACGCGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTcctc > 2:101438/1‑298 (MQ=255) ccaTGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCgctgc > 1:258462/1‑300 (MQ=255) gcgcGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGt > 1:118613/1‑300 (MQ=255) 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gCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTagcag < 1:8738/300‑1 (MQ=255) ccggcccggcGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGc < 2:556147/300‑1 (MQ=255) gcagGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAacac > 1:80157/1‑300 (MQ=255) cagGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACAcc > 1:350326/1‑300 (MQ=255) ggCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGNGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGGTTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTNAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACTCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCATCGcc > 2:686940/1‑300 (MQ=255) gCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTACCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCATCGccc > 2:809956/1‑300 (MQ=255) 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tGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCATCGCCCATAAAg < 1:119236/300‑1 (MQ=255) gCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCATCGCCCATAAAGATGCg < 1:426460/300‑1 (MQ=255) gTTATAAGCCGGAAGATTCGGAGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCAACCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCATCGACCATAAAGATGCGGGCg > 1:266045/1‑300 (MQ=255) 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TTCAGGCGCTGACGCCGGGGATTATTCAGGCGGGTTATTCCGTCGAGCAACAGCGCGAAGTGTTTGAGTTTGTCGCCAGCAGCGACTACTTCTCCGGCCCGACGTGGATGGCGATGTGTAAAGCGGCGATGGATGCGGCGCATGGCATCGAATACAGCACCGTGGTCACCACCATGGCGCGTAACGGCGTCGAGTTCGGCCTGCGGGTCAGCGGCCTGCCGGGGCAATGGTTTACCGGCCCGGCGCAGCAGGTGATCGGCCCGATGTTTGCCGGTTATAAGCCGGAAGATTCGGGGCTGGATATCGGCGACAGCGCCATCACCG‑AAACCTACGGTATTGGCGGATTTGCTATGGCGACCGCGCCCGCTATCGTCGCGCTGGTGGGCGGCACGGTGGAAGAAGCTATTGATTTCTCCCGTCAGATGCGCGAAATCACCCTCGGTGAAAACCCCAACGTCACCATTCCGCTGCTCGGTTTTATGGGCGTGCCGTCGGCAATCGACATCACCCGCGTGGGTAGCAGCGGCATTCTGCCGGTGATCAACACCGCCATCGCCCATAAAGATGCGGGCGTCGGCATGATTGGC > NC_000913/339082‑339668 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |