| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,635,088 | G→A | G83E (GGG→GAG) | yhiM → | inner membrane protein YhiM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,635,088 | 0 | G | A | 97.9% | 329.4 / ‑4.4 | 97 | G83E (GGG→GAG) | yhiM | inner membrane protein YhiM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (46/49); minor base C (1/1); total (47/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CATTAATGCATATTTCAATATTAGCAGGGATACCTGAGGAGTTTAAAGTGAACATATATATCGGGTGGCTTTTCAAATTAATCCCTTTGATTATGGGCTTAATTTGTATCGCGTTAGGTGGCTTTGTGCTGGAAAGTTCAGGGCAAAGCGAGTATTTCGTCGCGGGTCATGTGCTGATTTCTCTGGCGGCCATATGCCTGGCATTATTCACTACCGCATTTATTATCATTTCGCAGCTCACGCGCGGCGTTAATACGTTTTACAATACATTGTTCCCCATTATTGGCTATGCGGGGTCAATTATCACCATGATATGGGGTTGGGCACTGTTAGCAGGCAATGATGTGATGGCAGACGAGTTTGTCGCCGGCCATGTTATTTTCGGCGTTGGTATGATTGCCGCCTGTGTATCGACGGTGGCAGCGTCATCCGGTCACTTTCTGCTCATTCCCAAAAATGCAGCGGGGAGCAAGAGCGACGGAACACCGGTACAGGCTTATTCTTCATTAATCGGTAACTGCCTCATTGCCGTTCCCGTTTTACTCACCCTGCTCGGTTTCATTTGGTCTATTACGCTGTTACGTAGTGC > NC_000913/3634794‑3635382 | cATTAATGCATATTTCAATATTAGCAGGGATACCTGAGGAGTTTAAAGTGAACATATATATCGGGTGGCTTTTCAAATTAATCCCTTTGATTATGGGCTTAATTTGTATCGCGTTAGGTGGCTTTGTGCTGGAAAGTTCAGGGCAAAGCGAGTATTTCGTCGCGGGTCATGTGCTGATTTCTCTGGCGGCCATATGCCTGGCATTATTCACTACCGCATTTATTATCATTTCGCAGCTCACGCGCGGCGTTAATACGTTTTACAATACATTGTTCCCCATTATTGGCTATGCGGAGTCaa > 2:423069/1‑300 (MQ=255) 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CATTAATGCATATTTCAATATTAGCAGGGATACCTGAGGAGTTTAAAGTGAACATATATATCGGGTGGCTTTTCAAATTAATCCCTTTGATTATGGGCTTAATTTGTATCGCGTTAGGTGGCTTTGTGCTGGAAAGTTCAGGGCAAAGCGAGTATTTCGTCGCGGGTCATGTGCTGATTTCTCTGGCGGCCATATGCCTGGCATTATTCACTACCGCATTTATTATCATTTCGCAGCTCACGCGCGGCGTTAATACGTTTTACAATACATTGTTCCCCATTATTGGCTATGCGGGGTCAATTATCACCATGATATGGGGTTGGGCACTGTTAGCAGGCAATGATGTGATGGCAGACGAGTTTGTCGCCGGCCATGTTATTTTCGGCGTTGGTATGATTGCCGCCTGTGTATCGACGGTGGCAGCGTCATCCGGTCACTTTCTGCTCATTCCCAAAAATGCAGCGGGGAGCAAGAGCGACGGAACACCGGTACAGGCTTATTCTTCATTAATCGGTAACTGCCTCATTGCCGTTCCCGTTTTACTCACCCTGCTCGGTTTCATTTGGTCTATTACGCTGTTACGTAGTGC > NC_000913/3634794‑3635382 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |