| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,284,611 | G→A | V148I (GTC→ATC) | agaB → | galactosamine‑specific PTS enzyme IIB component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,284,611 | 0 | G | A | 98.0% | 507.7 / NA | 150 | V148I (GTC→ATC) | agaB | galactosamine‑specific PTS enzyme IIB component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base A (66/81); total (67/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
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attcaG‑GACATCCCTGGCGATCAAAAAGAACAAATCCCTGACTAAATCTAAAATCGCCTTAATATTGGTTTGAGGTAATAAAAATGCATGAAATAACCCTACTTCAGGGATTATCCATGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTGGCTTAATTACCGGTGGTCTGACAGAGTTGGCTTTCGCCGGATTAACCCCTGCAGGTGGTGTTCAgccgc > 1:165353/1‑300 (MQ=255) g‑gACATCCCTGGCGATCAAAAAGAACAAATCCCTGACTAAATCTAAAATCGCCTTAATATTGGTTTGAGGTAATAAAAATGCATGAAATAACCCTACTTCAGGGATTATCCCTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTGGCTTAATTACCGGTGGTCTGACAGAGTTGGCTTTCGCCGGATTAACCCCTGCAGGTGGTGTTCAGCCGCCCAAc > 1:62990/1‑300 (MQ=255) g‑gACATCCCTGGCGATCAAAAAGAACAAATCCCTGACTAAATCTAAAATCGCCTTAATATTGGTTTGAGGTAATAAAAATGCATGAAATAACCCTACTTCAGGGATTATCCCTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTGGCTTAATTACCGGTGGTCTGACAGAGTTGGCTTTCGCAGGATTAACCCCTGCAGGTGGTGTTCAGCCGCCCaaa > 2:343460/1‑299 (MQ=255) | TAATGGGTATTACCGCGGAAACCTACGGCTTTGGCATTCGTTTCTTTACTATCGAAAAAACCATTAACGTCATCGGCAAAGCTGCACCACATCAGAAGATCTTCCTGATTTGCCGTACGCCACAAACGGTACGTAAATTGGTAGAAGGTGGTATTGACCTGAAAGATGTCAACGTCGGCAATATGCATTTCTCGGAAGGGAAAAAGCAAATCAGCAGTAAAGTTTATGTCGATGACCAGGATCTCACGGACTTACGTTTTATTAAACAACGTGGCGTGAATGTTTTCATTCAG‑GACGTCCCTGGCGATCAAAAAGAACAAATCCCTGACTAAATCTAAAATCGCCTTAATATTGGTTTGAGGTAATAAAAATGCATGAAATAACCCTACTTCAGGGATTATCCCTGGCGGCGTTAGTTTTTGTTCTGGGGATTGATTTTTGGCTGGAAGCCTTATTTTTATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTGGCTTAATTACCGGTGGTCTGACAGAGTTGGCTTTCGCCGGATTAACCCCTGCAGGTGGTGTTCAGCCGCCCAAC > NC_000913/3284315‑3284906 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |