| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 3,013,819 | IS150 (+) +3 bp | coding (419‑421/1626 nt) | yqeB ← | XdhC‑CoxI family protein YqeB |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3013821 | 0 (0.000) | 118 (1.110) | 67/594 | 0.3 | 100% | coding (419/1626 nt) | yqeB | XdhC‑CoxI family protein YqeB |
| ? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
CGATCTCCTGCGGCGTTTCCGCACCTATGTTGTAACCAACGGGCGCATGTAAACGGGCAATATGTTCTTCAGCCACGCCTTTCTCACGCAATTGACGCAGGAAAAGCTGAACCTTGCGACGACTTGCCAGCAACCCCAACCATGCAATGGGCTGTTCAATGAGTTTGTCGAGGGCTTCACGATCCTGATTATTCGTGGCAATCAGGACAAAATTATCAGGGCGAATATCCAGTGCTTCCACTGCCGCACCAAACGACTCAGCATGGAGAAGCGTGGTTGATGGTGGGAATAGTTCAGGATTGAGGCTTTCGCGATAAATATCAGCAACGGCAATATCAAATCCTAATAGCGCCGCACTCTGGGCTATCGCCCGGTTGACATGCCCCGCGCCAATCAACACCAGACGTGGACGCATACCATGGACGCTGATAAATACTGACATTGCACCTCCACAATCTGACCCGACAGCATCCGCACCGTTACGAGCCATACGTCCATGGAATAATCGCGGCTTACGTTCCTGCAATGCCTGAAGCGACTCTTCAATCACCTTCCGCTCAACCATTCCGCCACCAATTGTACCGACGATAGAACCA > NC_000913/3013522‑3014117 | cGATCTCCTGCGGCGTTTCCGCACCTATGTTGTAACCAACGGGCGCATGTAAACNGGCAATATGTTCTTCAGCCACGCCTTTCTCACGCAATTGACGCAGGAAAAGCTGAACCTTGCGACGACTTGCCAGCAACCCCAACCATGCAATGGGCTGTTCAATGAGTTTGTCGAGGGCTTCACGATCCTGATTATTCGTGGCAATCAGGACAAAATTATCAGGGCGAATATCCAGTGCTTCCACTGCCGCACCAAACGACTCAGCATGGAGAAGCGTGGTTGATGGTGGGAATAGTTCAGGAt < 2:623493/300‑1 (MQ=255)cGATCTCCTGCGGCGTTTCCGCACCTATGTTGTAACCAACGGGCGCATGTAAACGTGCAATATGTTCTTCAGCCACGCCTTTCTCACGCAATTGACGCAGGAAAAGCTGAACCCTGCGACGACTTGCCAGCAACCCCAACCATGCAATGGGCTGTTCAATGAGTTTGTCGAGGGCTTCACGATCCTGATTATTCGTGGCAATCAGGACAAAATTATCAGGGCGAATATCCAGTGCTTCCACTGCCGCACCAAACGACTCAGCATGGAGAAGCGTGGTTGATGGTGGGAATAGTTCAGGAt < 2:290444/300‑1 (MQ=255) attagaagatatcaaaatatccttaaagaacatggtattaaacaaagcatgtccagaaaaggcaattgtctggataatgctgtggtggagtgtttctttggaaccttaaagtcggagtgtttttatcttgatgagttcagtaatataagcgaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacagcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAtt > 1:731947‑M1/297‑300 (MQ=255) atgagaagatatcaaaatatccttaaagaacatggtattaaacaaagcatgtccagaaaaggcaattgtctggataatgctgtggtggagtgtttctttggaaccttaaagtcggagtgtttttatcttgatgagttcagtaatataagcgaactgaaggatgctgttacggaatatattgaatactacaacggcagaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaGAtt > 2:648200‑M1/297‑300 (MQ=255) 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gtacaGATTGAGGCTTTCGCGATAAATATCAGCAACGGCAATATCAAATCCTAATAGCGCCGCACTCTGGGCTATCGCCCGGTTGACATGCCCCGCGCCAATCAACACCAGACGTGGACGCATACCATGGACGCTGATAAATACTGACATTGCACCTACACAATCTGACCCGACAGCATCCGCACCGTTACGAGCCGTACGTCCATGGAATAATCGCGGCTTACGTTCCTGCAATGCCTGAAGCGACTCTTCAATCACCTTCCGCTTAACCATTCAGCCACCAATTgtaccgacgagaga < 2:242405‑M1/295‑5 (MQ=255) acaGATTGAGGCTTTCGCGATAAATATCAGCAACGGCAATATCAAATCCTAATANCGCCGCACTCTGGGCTATCGCCCGGTTGACATGCCCCGCGCCAATCAACACCAGACGTGGACGCATACCATGGACGCTGATAAATACTGACATTGCACCTCCACAATCTGACCCGACAGCATCCGCACCGTTACGAGCCATACGTCCATGGAATAATCGCGGCTTACGTTCCTGCAATGCCTGAAGCGNCTCTTCAATCACCTTCCGCTCAACCATTCCGCCACCAATTGTACCGACGATAGAAc > 2:777377‑M1/4‑300 (MQ=255) aGATTGAGGCTTTCGCGATAAATATCAGCAACGGCAATATCAAATCCTAATAGCGCCGCACTCTGGGCTATCGCCCGGTTGACATGCCCCGCGCCAATCAACACCAGACGTGGACGCATACCATGGACGCTGATAAATACTGACATTGCACCTCCACAATCTGACCCGACAGCATCCGCACCGTTACGAGNCATACGTCCATGGAATAATCGCGGCTTACGTTCCTGCAATGCCTGAAGCGACTCTTCAATCACCTTCCGCTCAACCATTCCGCCACCAATTGTACCGACGATAGAACCa < 1:614079‑M1/299‑1 (MQ=255) | CGATCTCCTGCGGCGTTTCCGCACCTATGTTGTAACCAACGGGCGCATGTAAACGGGCAATATGTTCTTCAGCCACGCCTTTCTCACGCAATTGACGCAGGAAAAGCTGAACCTTGCGACGACTTGCCAGCAACCCCAACCATGCAATGGGCTGTTCAATGAGTTTGTCGAGGGCTTCACGATCCTGATTATTCGTGGCAATCAGGACAAAATTATCAGGGCGAATATCCAGTGCTTCCACTGCCGCACCAAACGACTCAGCATGGAGAAGCGTGGTTGATGGTGGGAATAGTTCAGGATTGAGGCTTTCGCGATAAATATCAGCAACGGCAATATCAAATCCTAATAGCGCCGCACTCTGGGCTATCGCCCGGTTGACATGCCCCGCGCCAATCAACACCAGACGTGGACGCATACCATGGACGCTGATAAATACTGACATTGCACCTCCACAATCTGACCCGACAGCATCCGCACCGTTACGAGCCATACGTCCATGGAATAATCGCGGCTTACGTTCCTGCAATGCCTGAAGCGACTCTTCAATCACCTTCCGCTCAACCATTCCGCCACCAATTGTACCGACGATAGAACCA > NC_000913/3013522‑3014117 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |