| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 4,430,711 | IS150 (–) +3 bp | coding (848‑850/1413 nt) | cycA → | D‑serine/alanine/glycine/:H(+)symporter |
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| * | ? | NC_000913 | = 3722075 | NA (NA) | 102 (0.960) | 72/596 | 0.2 | 100% | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4430713 | 0 (0.000) | coding (850/1413 nt) | cycA | D‑serine/alanine/glycine/:H(+)symporter | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
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GTACACAAACGGGCTTTTCTCCGGGACTACCGAACTCCACGGCGTCACGGACATAATCACAATCAGCGCGAAGACGTAGAACATAATGATACGGATCGGAATGGAGTTAATCGCGCGTGGCAGTGATTTCTCTGGATCTTTGGTTTCCGCAGCTGTTGTACCTACCAGCTCAATCCCCACGAAAGCGAAAACCGCTATCTGGAATCCGGCAAAGAAGCCACTTAAACCTTTCGGGAACCAGCCGCCGTCATTCCACAAATGCGCGAATGACGCTTCCACACCAGTCGGTGACTGAAAGTt > 1:80425/1‑299 GTACACAAACGGGCTTTTCTCCGGGACTACCGAACTCCACGGCGTCACGGACATAATCACAATCAGCGCGAAGACGTAGAACATAATGATACGGATCGGAATGGAGTTAATCGCGCGTGGCAGTGATTTCTCTGGATCTTTGGTTTCCGCAGCTGTTGTACCTACCAGCTCAATCCCCACGAAAGCGAAAACCGCTATCTGGAATCCGGCAAAGAAGCCACTTAAACCTTTAGGGAACCAGCCGCCGTCATTCCACAAATGCGCGAATGACGCTTCCACCCCAGTCGGTGACTGAAAGTG > 2:527036/1‑300 CACAAACGGGCTTTTCTCCGGGACTACCGAACTCCACGGCGTCACGGACATAATCACAATCAGCGCGAAGACGTAGAACATAATGATACGGATCGGAATGGAGTTAATCGCGCGTGGCAGTGATTTCTCTGGATCTTTGGTTTCCGCAGCTGTTGTACCTACCAGCTCAATCCCCACGAAAGCGAAAACCGCTATCTGGAATCCTGCAAAGAAGCCACTTAAACCTTTCGGGAACCAGCCGCCGTCATTCCACAAATGCGCGAATGACGCTTCCACACCAGTCGGTGACTGAAAGTGCAT < 1:376124/300‑1 GTATGAGAAGATATCAAAATATCCTTAAAGAACATGGTATTAAACAAAGCATGTCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3721778‑3722075‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aCAAACGGGCTTTTCTCCGGGACTACCGAACTCCACGGCGTCACGGACATAATCACAATCAGCGCGAAGACGTAGAACATAATGATACGGATCGGAATGGAGTTAATCGCGCGTGGCAGTGATTTCTCTGGATCTTTGGTTTCCGCAGCTGTTGTACCTACCAGCTCAATCCCCACGAAAGCGAAAACCGCTATCTGGAATCCGGCAAAGAAGCCACTTAAACCTTTCGGGAACCAGCCGCCGTCATTCCACAAATGCGCGAATGACGCTTCCACACCAGTCGGTGACTGAAAGTGCAT < NC_000913/4430713‑4430416 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |