| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 59,123 | IS150 (+) +3 bp | coding (3‑5/159 nt) | yabQ → | protein YabQ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 59123 = | 0 (0.000) | 108 (1.010) | 65/598 | 0.3 | 100% | coding (650/651 nt) coding (3/159 nt) |
yabP yabQ |
putative uncharacterized protein YabP protein YabQ |
| ? | NC_000913 | = 3722075 | NA (NA) | noncoding (1443/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 59125 | 0 (0.000) | 95 (0.890) | 56/596 | 0.6 | 100% | coding (5/159 nt) | yabQ | protein YabQ |
| ? | NC_000913 | 3720633 = | NA (NA) | noncoding (1/1443 nt) | IS150 | repeat region | |||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TCTCGGTGATCCGTGTCCTGCACGACGCCTTGCGTCACTAGCCTCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/59417‑59123‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATA < NC_000913/3722075‑3721779 tgtataagagacagGTCCTGCACGACGCCTTGCGTCACTAGCCTCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGTGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTAC < 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2:249450/300‑1TCTCGGTGATCCGTGTCCTGCACGACGCCTTGCGTCACTATCCTCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTAC < 2:438724/300‑1TCTCGGTGATCCGTGTCCTGCACGACGCCTTGCGTCACTAGCCTCTTCTCTAGCTCATCATGCAGTTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTGTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTAC < 2:825900/300‑1TCTCGGTGATCCGTGTCCTGCACGACGCCTTGCGTCACTAGCCTCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCGCGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTGCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTAC < 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2:778272/300‑1TCTCGGTAATCCGTGTCCTGCACTACGCCTTGCGTCACGAGCCTCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTTAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACGTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTAa < 2:39119/300‑2 CGGTGATCCGTGTCCTGCACGACGCCTTGCGTCACTAGCCTCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTACTGA > 2:305219/1‑300 gtaATCCGTGTCCTGCACTACGCCTTTCGTCACTAGCCTCTTCTCTAGCTCATCAGGCAGGTCTTTCTAATTGGGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTACTGACC < 2:462369/297‑1 GTGATCCGTGTCCTGCACGACTCCTTGCGTCACTAGCCTCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTGCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTACTGACC < 2:649606/300‑1 TCCGTGTCCTGCACGACGCCTTGCGTCACTAGCCTCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTACTGACCCCAA > 1:490158/1‑300 TCCGTGTCCTGCACGACGCCTTGCGTCACTAGCCTCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCAACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCNTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATNGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTGGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAACAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTACTGACCACAA > 2:568215/1‑300 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TTGCGTCACTAGCCTCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCNTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACAC < 1:602019/300‑1 TCACTAGCCTCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGC > 1:423721/1‑300 GCCTCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAG < 1:473224/300‑1 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TCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAATGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACTAGGCATATAGGTC < 1:706761/300‑1 TCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTC < 1:184736/300‑1 TCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTCTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTCTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTC < 2:357137/300‑1 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GTTCTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTAAGTTCGCTTATATTACTGAACTNATCAAGATAAAAACACTCCGAATTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGGTATTTTGATATCTTCTCAT > 2:194450/1‑300 GTTCTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTATGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTACTACCATGTTCTTTACGGATCTTTTGATATCTTCTCAT > 2:125253/1‑300 TTCTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGANTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTATAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATA < 2:628409/300‑1 TCTCGGTGATCCGTGTCCTGCACGACGCCTTGCGTCACTAGCCTCTTCTCTAGCTCATCATGCAGGTCTTTCTAATTGTGAAATCATCCCACGCTACTGCTAAGGTTGAAGGGGCGTTCCAGCCCCTTCAACCTTAGCTTATTCTGGCTCATTCAATAATTGCGTTGTCAGTAATTTGTTCAGCAGTACTTTTTTAGTAGCAACTTCTTCAGTAGCAACTCCTTTAGTATCAATTTTTTTGGGGGGGATTTTATTAATAATAATTACCTCATCATATAAGGAGGTAGCACCGTTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/59417‑59123‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTTCTGCTGTTGTAGTATTCAATATATTCCGTAACAGCATCCTTCAGTTCGCTTATATTACTGAACTCATCAAGATAAAAACACTCCGACTTTAAGGTTCCAAAGAAACACTCCACCACAGCATTATCCAGACAATTGCCTTTTCTGGACATGCTTTGTTTAATACCATGTTCTTTAAGGATATTTTGATATCTTCTCATA < NC_000913/3722075‑3721779 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |