| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 4,525,237 | G→A | A189A (GCC→GCT) | yjhI ← | putative DNA‑binding transcriptional regulator YjhI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,525,237 | 0 | G | A | 99.3% | 491.1 / NA | 142 | A189A (GCC→GCT) | yjhI | putative DNA‑binding transcriptional regulator YjhI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (65/76); minor base C (1/0); total (66/76) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.65e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TTTATCAAGGGTTCCGTCACGATGAAACGTGCTGGATACCGGTGGAATAATGCCGCTGAATTTTTTCATTACCTCAGTTTCCTTTTCGTAAGTGCTCATTTTCGTTTCTGTATCCCAGCCCATATGATATTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCGCCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACT > NC_000913/4524942‑4525532 | tttATCAAGTGTTCCGTCACGATGAAACGTGCTGGATACCGGTGGAATAATGCCGCTGAATTTTTTCATTACCTCAGTTTCCTTTTCGTAAGTGCTCATTTTCGTTTCTGTATCCCAGCCCATATGATATTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATAGccc < 2:267642/300‑1 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cTATAGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGGCTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCGCCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACt > 2:355054/1‑300 (MQ=255) cTATAGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCGCCCAAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACt > 2:252308/1‑300 (MQ=255) cTATAGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTACATCGCACCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACt > 2:46662/1‑300 (MQ=255) | TTTATCAAGGGTTCCGTCACGATGAAACGTGCTGGATACCGGTGGAATAATGCCGCTGAATTTTTTCATTACCTCAGTTTCCTTTTCGTAAGTGCTCATTTTCGTTTCTGTATCCCAGCCCATATGATATTTGCTCAGCGCATTTCCGGAGCAATTCCAGATAGCTGTCTATCTTATTTCCTGAATAAACTACCGGATCGCCAGAAAGTGAGATTGCATAGTTAACTCTGTTATACATATTGAATACCGGCATACTTAAACATACCGCCCCATAGGTTGATTCTTCGTTGTCTATGGCCCATCCCCGAAGGCGTGTTTTTTGTAATTCTTCCAGAAACAATTTTTTATCGGTAAATGTATTGCGCGTATGTGGAGTTAACGTGAGTGCTTCTAAAAAATAATCCAGTTCTTCTCGTGTCTTCCAGGCTAATAATGCCTTACCCAACGCGGTAATATGCAACTCAAGTTTTTTGCCAATCCAGCTTTTGCTCGTCGGTACAGAGTCCGGACTTTCGATCTTGTCGAGATAGATAGCCGAAATGCTCTCCATCGCCCCAAGATGACAAACCAGTCCACTTTTCAGCGACAACT > NC_000913/4524942‑4525532 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |