| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 3,898,481 | G→A | D154N (GAT→AAT) | cbrC → | PF03691 family colicin E2 tolerance protein CbrC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,898,481 | 0 | G | A | 99.4% | 528.9 / NA | 156 | D154N (GAT→AAT) | cbrC | PF03691 family colicin E2 tolerance protein CbrC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (63/92); minor base C (1/0); total (64/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
GTCCGTGGTGTATTGCGGACGGTTCTGCTGCTGAAAAGTTTGCAGGTAGTTTTCAGGATGATGCCAGCATAGAAGGTGTTGAATTTGAGTATGATGAAGAGGACGAATTTGCCGGTATTAAGAACACATATCCTGATGAAATGCTGAAAGAGTTGGTTGAACGCACGCCAGGTTATCATGGATGGCAGCAGGAATTCTGGCTCGCGCATTGTGGCGATTTCTGTGTTTTTATCGGCTATGTGGGCTGGAATGATATAAAAGATCGCCTCGATGAATTTGCCAACCTTGAAGAAGATTGTGAGAATTTCGGTATTAGAAATTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGC > NC_000913/3898188‑3898776 | gTCCGTGGTGTATTGCGGACGGTTCTGCTGCTGAAAAGTTTGCAGGTAGTTTTCAGGATGATGCCAGCATAGAAGGTGTTGAATTTGAGTATGATGAAGAGGACGAATTTGCCGGTATTAAGAACACATATCCTGATGAAATGCTGAAAGAGTTGGTTGAACGCACGCCAGGTTATCATGGATGGCAGCAGGAATTCTGGCTCGCGCATTGTGGCGATTTCTGTGTTTTTATCGGCTATGTGGGCTGGAATGATATAAAAGATCGCCTAGATGAATTTGCCAACCTTGAAGAAAATtgtg > 1:700705/1‑300 (MQ=255) 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tGCCAACCTTGAAGAAAATTGTGAGAATTTCGGTATTAGAAATTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTa < 1:195175/300‑1 (MQ=255) ccTTGAAGAAAATTGTGAGAATTTCGGTATTAGAAATTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGa > 1:377860/1‑300 (MQ=255) agaaaaTTGTGAGAATTTCGGTATTATAAATTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGCGGTCATTGTCAGGGTTATCCCTTCCGCTTTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGTTGATTTTTCGTAGTTATTCAAAGAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTCAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTGATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGc < 2:121575/300‑1 (MQ=255) | GTCCGTGGTGTATTGCGGACGGTTCTGCTGCTGAAAAGTTTGCAGGTAGTTTTCAGGATGATGCCAGCATAGAAGGTGTTGAATTTGAGTATGATGAAGAGGACGAATTTGCCGGTATTAAGAACACATATCCTGATGAAATGCTGAAAGAGTTGGTTGAACGCACGCCAGGTTATCATGGATGGCAGCAGGAATTCTGGCTCGCGCATTGTGGCGATTTCTGTGTTTTTATCGGCTATGTGGGCTGGAATGATATAAAAGATCGCCTCGATGAATTTGCCAACCTTGAAGAAGATTGTGAGAATTTCGGTATTAGAAATTCTGATCTAGCTAAATGCCTGCAAAAGGGTGGTCATTGTCAGGGTTATCTCTTCCGCTGTCTCCACTGCGGCAAGCTGAGACTGTGGGGTGATTTTTCGTAGTTATTTAAATAATGAGAACAGGCCGGAGCGTAATTCACACATCCGGCCTTATTTCTTAAGCTTAACCGAGTGCTAATTCTGCGGCAGCGGCTTTATCAGCGATTACCATCAGCGAAGGATGCAGCTGCAACACGGAAGCTGGAACATCTTCGGTAACCGGACCTTGC > NC_000913/3898188‑3898776 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |