| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,607,928 | C→T | P493L (CCC→CTC) | zntA → | Zn(2(+))/Cd(2(+))/Pb(2(+)) exporting P‑type ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,607,928 | 0 | C | T | 98.8% | 272.8 / NA | 81 | P493L (CCC→CTC) | zntA | Zn(2(+))/Cd(2(+))/Pb(2(+)) exporting P‑type ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (36/44); total (37/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGTTAGTTATCTCAACGCCTGCGGCGATTACCTCCGGGCTGGCGGCGGCAGCGCGTCGTGGGGCGTTGATTAAAGGCGGAGCGGCGCTGGAACAGCTGGGTCGTGTTACTCAGGTGGCGTTTGATAAAACCGGTACGCTGACCGTCGGTAAACCGCGCGTTACCGCGATTCATCCGGCAACGGGTATTAGTGAATCTGAACTGCTGACACTGGCGGCGGCGGTCGAGCAAGGCGCGACGCATCCACTGGCGCAAGCCATCGTACGCGAAGCACAGGTTGCTGAACTCGCCATTCCCACCGCCGAATCACAGCGGGCGCTGGTCGGGTCTGGCATTGAAGCGCAGGTTAACGGTGAGCGCGTATTGATTTGCGCTGCCGGGAAACATCCCGCTGATGCATTTACTGGTTTAATTAACGA‑ACTGGAAAGCGCCGGGCAAACGGTAGTGCTGGTAGTACGTAACGATGACGTGCTTGGTGTCATTGCGTTACAGGATACCCTGCGCGCCGATGCTGCAACTGCCATCAGTGAACTGAACGCGCTGGGCGTCAAAGGGGTGATCCTCACCGGCGATAATCCACGCGC > NC_000913/3607633‑3608216 | gCGTTAGTTATCTCAACGCCTGCGGCGATTACCTCCGGGCTGGCGGCGGCAGCGCGTCGTGGGGCGTTGATTAAAGGCGGAGCGGCGCTGGAACAGCTGGGTCGTGTTACTCAGGTGGCGTTTGATACAACCGGTACGCTGACCGTCGGTAAACCGCGCGTTACCGCGATTCATCCGGCAACGGGTATTAGTGAATCTGAACTGCTGCCACTGGCGGCGGCGGTCGAGCAAGGCGCGACGCATCCACTGGCGCAAGCCATCGTACGCGAAGCACAGGTTGCTGAACTCGCCATTCTCAcc > 2:316192/1‑300 (MQ=255) cGTTAGTTATCTCAACGCCTGCGGCGATTACCTCCGGGCTGGCGGCGGCAGCGCGTCGTGGGGCGTTGATTAAAGGCGGAGCGGCGCTGGAACAGCTGGGTCGTGTTACTCAGGTGGCGTTTGATAAAACCGGTACGCTGACCGTCGGTAAACCGCGCGTTACCGCGATTCATCCGGCAACGGGTATTAGTGAATCTGAACTGCTGACACTGGCGGCGGCGGTCGAGCAAGGCGCGACGCATCCACTGGCGCAAGCCATCGTACGCGAAGCACAGGTTGCTGAACTCGCCATTCTCAccg > 2:286116/1‑300 (MQ=255) tctcAACGCCTGCGGCGATTACCTCCGGGCTGGCGGCGGCAGCGCGTCGTGGGGCGTTGATTAAAGGCGGAGCGGCGCGGGAACAGCTGGGTCGTGTTACTCAGGTGGCGTTTGATAAAACCGGTACGCTGACCGTCGGTAAACCGCGCGTTACCGCGATTCATCCGGCAACGGGTATTAGTGAATCTGAACTGCTGACACTGGCGGCGGCGGTCGAGCAAGGCGCGACGCATCCACTGGCGCAAGCCATCGTACGCGAAGCACAGGTTGCTGAACTCGCCATTCTCACCGCCGAATcac < 2:227728/300‑1 (MQ=255) ctcAACGCCTGCGGCGATTACCTCCGGGCTGGCGGCGGCAGCGCGTCGTGGGGCGTTGATTAAAGGCGGAGCGGCGCCGGAACAGCTGGGTCGTGTTACTCAGGTGGCGTTTGATAAAACCGGTACGCTGACCGTCGGTAAACCGCGCGTTACCGCAATTCATCCGGCAACGGGTATTAGTGAATCTGAACTGCTGACACTGGCGGCGGTGGTCGAGCAAGGAGCGACGCATCCACTGGCGCAAGCCACCGTACGCGCAGCCCAGGTTGCTGAACTCGCCATTCTCACCGCCGAATcaca > 2:229187/1‑300 (MQ=255) cAACACCTGCGGCGACTACCTCCTGGCTGGCGGCGGCAGCGCGTCGTGGGGCGTTGATGAAAGGCGGAGCGGCGCTGGAACAGCTGGGTCGTGTTACTCAGGTGGCGTTTGAGAAAACCGGTACACTTACCGTCGGGAAACCGCGCGTTACCGCGATTCATCCGGCAACGGGTATTAGTGAATCTGAACTGCTGACACTGGCGGCGGCGGTCGAGCAAGGCGCGACGCATCCACTTGCGCAAGCCATCGTACGCGAAGCACAGGTTGCTGAACTCGCCATTCTCACCGCCGAATCACAGc < 2:317613/300‑1 (MQ=255) tACCTCCTGGCTGGCGGCGGCAGCGCGTCGTGGGGCGTTGATTAAAGGCGGAGCGGCGCTGGAACAGCTGGTTCGTGTTACTCAGGTGGCGTTTGATAAAACCGGTACGCTGACCGTCGGTAAACCGCGCGTTACCGCGATTCATCCGGCAACGGGTATTAGTGAATCTGAACTGCTGACACTGGCGGCGGCGGTCGAGCAAGGCGCGACGCATCCACTGGCGCAAGCCATCGTACGCGAAGCACAGGTTGCTGAACTCGCCATTCTCACCGCCGAATCACAGCGGGCGCTGGTCGGGTc < 1:388516/300‑1 (MQ=255) aCCTCCGGGCTGGCGGCGGCAGCGCGTCGTGGGGCGTTGATTAAAGGCGGAGCGGCGCTGGAAAAGCTGGGTCGTGTTACTCAGGTGGCGTTTGATACAACCAATACGCTGACCGTCGGTAGACCGCGTGTTACCGCGATTCATCCGGCAACGGGTATTAGTGAATCTGAACTGCTGACACTGGCGGCGGCGGTAGAGCACGGCGCGACGCATTCACTGGCGCAAGCCATCGTACGCGAAGCACAGGGTGCTGAACTCGACATTCTCACGGCCGAATCACGGCGGGCGATGGTCGGGTCt > 2:145887/1‑300 (MQ=255) ccGGGCTGGCGGCGGCAGCGCGTATTGGTGCGTTGATTAAAGGCGGAGCGGCGCTGGAACAGCTGGGTCGTGTTACTCAGGTGGCGTTTGATAAAACCGGTACGCNGACCGTCGGTAAACCGCGCGTTACCGCGATTCATCCGGCAACGGGTATTAGTGAATCTGAACTGCTGACACTGGCGGCGGCGGTCGAGCAAGGCGCGACGCATCCACTGGCGCAAGCCATCGTACGCGAAGCACAGGTTGCTGAACTCGCCATTCTCACCGCCGAATCACAGCGGGCGCTGGTCGGGTCTGGCa < 2:608114/300‑1 (MQ=255) ggcggcggcAGCGCGTCGTGGGGCGTTGATTAAAGGCGGAGCGGCGCTGGAACAGCTGGGTCGTGTTACTCAGGTGGCGTTTGATAAAACCGGTACGCTGACCGTCGGTAAACCGCGCGTTACCGCGATTCATCCGGCAACGGGTATTAGTGAATCTGAACTGCTGACACTGGCGGCGGCGGTCGAGCAAGGCGCGACGCATCCACTGGCGCAAGCCATCGTACGCGAAGCACAGGTTGCTGAACTCGCCATTCTCACCGCCGAATCACAGCGGGCGCTGGTCGGGTCTGGCATTGAAgc > 1:665975/1‑300 (MQ=255) ctgcggcATCGCGTCGTGGGGCGTTGATTAAAGGCGGAGCGGCGCTGGAACAGCTGGGTCGTGTTACTCAGGTGGCGTTTGACAAAACCGGTACGCTGACCGTCGGTAAACCGCGCGTTACCGCGATTCATCCGGCAACGGGTATTAGTGAATCTGAACTGCTGACACTGGCGGCGGCGGTCGAGCAAGGCGCGACGCATCCACTGGCGCAAGCCATCGTACGCGAAGCACAGGTTGCTGAACTCGCCATTCTCACCGCCGAATCACAGCGGGCGCTGGTCGGGTCTGGCATTGAAgcgc < 2:418846/298‑1 (MQ=255) 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GCGTTAGTTATCTCAACGCCTGCGGCGATTACCTCCGGGCTGGCGGCGGCAGCGCGTCGTGGGGCGTTGATTAAAGGCGGAGCGGCGCTGGAACAGCTGGGTCGTGTTACTCAGGTGGCGTTTGATAAAACCGGTACGCTGACCGTCGGTAAACCGCGCGTTACCGCGATTCATCCGGCAACGGGTATTAGTGAATCTGAACTGCTGACACTGGCGGCGGCGGTCGAGCAAGGCGCGACGCATCCACTGGCGCAAGCCATCGTACGCGAAGCACAGGTTGCTGAACTCGCCATTCCCACCGCCGAATCACAGCGGGCGCTGGTCGGGTCTGGCATTGAAGCGCAGGTTAACGGTGAGCGCGTATTGATTTGCGCTGCCGGGAAACATCCCGCTGATGCATTTACTGGTTTAATTAACGA‑ACTGGAAAGCGCCGGGCAAACGGTAGTGCTGGTAGTACGTAACGATGACGTGCTTGGTGTCATTGCGTTACAGGATACCCTGCGCGCCGATGCTGCAACTGCCATCAGTGAACTGAACGCGCTGGGCGTCAAAGGGGTGATCCTCACCGGCGATAATCCACGCGC > NC_000913/3607633‑3608216 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |