Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 2,175,290 | G→A | S344S (AGC→AGT) | gatZ ← | putative tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 2 chaperone |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,175,290 | 0 | G | A | 99.0% | 331.9 / NA | 100 | S344S (AGC→AGT) | gatZ | putative tagatose‑1,6‑bisphosphate aldolase 2 chaperone |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (69/30); total (70/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCAAAGGTTAATGCGGGACCGACTTTCAATATTGCAAAGTGATCGCGGACTAATTCCCAATAAGCCGTCCGGGTCTGGTAATCGGTAGAATGTGCTTCATAAACCATTCGGGTGTTTTCTATCC > NC_000913/2174998‑2175585 | cagCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGACTGTAAc < 1:690122‑M2/297‑1 (MQ=255) 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gTAATAACGAATACGATCCGACAGACTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCAAAGGTTAATGCGGGACCGACTTTCAATATTGCAAAGTGATCGCGGACTAATTCCCAATAAGCCGTCCGGGTCTGGTAATCGGTAGAATGTGCTTCATAAAc > 1:410724/1‑300 (MQ=255) gTAATAACGAATACGATCCGACAGACTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCAATTCTTAAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTNTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCAAAGGTTAATGCGGGACCGACTTCCAATATTGCAAAGTGATCGCGGACTAATTACAAATAAGCCGTCCGGGTCTGGTAGTCGGTAGAATGTACTTCATAAAc > 2:153476/1‑300 (MQ=255) aaCGAATACGATCCGACAGACTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAANGCAAAGGTTAATGCGGGACCGACTTTCAATATTGCAAAGTGATCGCGGACTAATTCCCAATAAGCCGTCCGGGTCTGGTAATCGGTAGAATGTGCTTCATAAACCATTc > 1:477971/1‑300 (MQ=255) gAATACGATCCGACAGACTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCAAAGGTTAATGCGGGACCGACTTTCAATATTGCAAAGTGATCGCGGACTAATTCCCAATAAGCCGTCCGGGTCTGGTAATCGGTAGAATGTGCTTCATAAACCATTCggg > 1:240264/1‑300 (MQ=255) gACAGACTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCATTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCAAAGGTTAATGCGGGACCGACTTTCAATATTGCAAAGTGATCGCGGACTAATTCCCAATAAGCCGTCCGGGTCTGGTAATCGGTAGAATGTGCTTCATAAACCATTCGGGTGTTTTCTATc < 1:596016/300‑1 (MQ=255) aCAGACTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCAAAGGTTAATGCGGGACCGACTTTCAATATTGCAAAGTGATCGCGGACTAATTCCCAATAAGCCGTCCGGGTCTGGTAATCGGTAGAATGTGCTTCATAAACCATTCGGGTGTTTTCTATcc < 1:41067/300‑1 (MQ=255) | CTTCGCTACGATCGACAAAAGAAATTCCGCTACGAACAAACAGGTTAGTCATATACCGTCCTTATTCCGCACAGCCGTAGCGATAGGCGCGCAAAACATCATAAATTTTATCCATAATCAGCTGATGCGGTATTGCTGATAATTCCCCGGACTGAATGCGTTCAAATTGTTTGGGAAGATACTGACTAATCATGCCCAGTGGGATGTCCACGCCTTCAAGATTCACCATCATCGTTTCGACGCTATTTTTAATCCGACTATGCGGCCAGTAATAACGAATACGATCCGACAGGCTGTAACGAATATCCAGTAATGAATCGTTAAAACCCGTACGATAATATTTTTTCCAGTATTGCGGTTCGTCGAGCATCACTTCTTCAATTACCGCCAGGCAACCGCTGCGATTTTCAGGGGCGATAAGTTCCTGCTCAATTTGTGCCAGTGCAAATATCGCCTCGCGTAAAGCAAAGGTTAATGCGGGACCGACTTTCAATATTGCAAAGTGATCGCGGACTAATTCCCAATAAGCCGTCCGGGTCTGGTAATCGGTAGAATGTGCTTCATAAACCATTCGGGTGTTTTCTATCC > NC_000913/2174998‑2175585 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |