| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 2,105,022 | G→A | V21V (GTC→GTT) | wbbJ ← | putative lipopolysaccharide biosynthesis O‑acetyl transferase WbbJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,105,022 | 0 | G | A | 99.3% | 469.7 / NA | 137 | V21V (GTC→GTT) | wbbJ | putative lipopolysaccharide biosynthesis O‑acetyl transferase WbbJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (70/66); total (70/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
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tCAATAAAACATCTCTAACAAGCCGAATAAAACCACAGAGACCATATCGTTTAGCGAGTTTTAAGATCATCGATCACCTCTTCAAGAACATCCCTTAAGTAACTTCCTGTTCGAATTTTCTTAGAAATAATTTTTGTATTCTCACTAATTTGCTTATAAGTTTCTATTGTCATGGAGTCAACAATCTCTTGCATTTCTTTGATTGATCCCACTGCATGTCCTATTCTATTATCTACAATGAAATCCGCAAGGGCGGCTTTATCCCATATAAATACTGGAAGTTCCATTGAAAGATAAaga < 2:251118/300‑1 (MQ=255) cAATAAAACATCTCTAACAAGCCGAATAAAACCACATAGACCATATCGTTTAGCGAGTTTTAAGATCATCGATCACCTCTTCAAGAACATCCCTGAAGTAACTTCCTGTTCGAATTTTCTGAGAAATAATTTTTGTATTCTCACTAATTTGCTTATAAGTTTCTATTGTCATGGAGTCAACAATCTCTTGCATTTCTTTGATTGATCCCACTGCATATCCTATTCTATTATCTACAATGAAATCCGCAAGGGCGGCTTTATCCCATATAAATACTGGAAGTTCCATTGAAAGATAAagag < 2:181633/300‑1 (MQ=255) cAATAAAACATCTATAACAAGCCGAATAAAACCACAGAGACCATATCGTTTAGCGAGTTTTAAGATCATCGATCACCTCTTCAAGAACATCCATGAAGTAACTTCCTGTTCGAATTTTCTGAGAAATAATTTTTGTATTCTCACTAATTTGCTTATAAGTTTCTATTGTCATGGAGTCAACAATCTCTTGCATTTCTTTGATTGATCCCACTGCATATCCTATTCTATTATCTACAATGAAATCCGCAAGGGCGGCTTTATCCCATATAAATACTGGAAGTTCCATTGAAAGATAAagag > 2:276067/1‑300 (MQ=255) | GCGAACTCATTGGATCAGAGTGCTTAAAGGAACCGTGATTATGATCGGTAATAAATACTTTACTTGCAATAAGCGTATCCCGACCTATCGTAACGCTCTCAATTGAGGCGATATGAACATAGTCGTTAACTTGCACATTATCGGAAAAAAAAATCACGCCACGTCCAAATGCATCCAGCCTGAGACCGACTCCACTTGTGAAATTTTCACCAAAATTAATGCTACCATCATTGCGAATATAGCAGGGAAATCGAATAATTCTACAGTTCCGGTAAAATACACGAGTCAATAAGACATCTCTAACAAGCCGAATAAAACCACAGAGACCATATCGTTTAGCGAGTTTTAAGATCATCGATCACCTCTTCAAGAACATCCCTGAAGTAACTTCCTGTTCGAATTTTCTGAGAAATAATTTTTGTATTCTCACTAATTTGCTTATAAGTTTCTATTGTCATGGAGTCAACAATCTCTTGCATTTCTTTGATTGATCCCACTGCATATCCTATTCTATTATCTACAATGAAATCCGCAAGGGCGGCTTTATCCCATATAAATACTGGAAGTTCCATTGAAAGATAAAGAGAT > NC_000913/2104730‑2105317 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |