| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NC_000913 | 1,582,610 | G→T | intergenic (‑86/+316) | ydeN ← / ← ydeO | putative sulfatase YdeN/DNA‑binding transcriptional dual regulator YdeO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,582,610 | 0 | G | T | 99.1% | 353.5 / NA | 105 | intergenic (‑86/+316) | ydeN/ydeO | putative sulfatase YdeN/DNA‑binding transcriptional dual regulator YdeO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (57/47); total (57/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
AACCAAGATCATCCATGGTCAGTACGATAATATTTGGCTTTCCTTTGGTACTGTATTCTGTCGGCGTAAAGTCTGAGAAAGCAACGTTTGTTTTGGTTGCTTTCAGCTTTACATCATCTGCCGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAATTGAGATCATAAATAATCATGCAACAGGTTATGCAAGTGCATAAATATGTGATGGATGTCACTTATTTATTTCAATAAATATATCGCCTAAAAACAACGCGGGGCAGGGAATGGCTGCCCCATTTAATTCTTACGCAGCGTGTGTGGTT > NC_000913/1582317‑1582905 | aaCCAAGATCATCCATGGTCAGTACGATAATATTTGGCTTTCCTTTGGTACTGTATTCTGTCGGCGTAAAGTCTGAGAAAGCAACGTTTGTTTTGGTTGCTTTCAGCTTTACATCATCTGCCGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAatagatag > 1:703846/1‑300 (MQ=255) 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aTAAATAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAATTGAGATCATAAATAATCATGCAACAGGTTATGCAAGTGCATAAATATGTGATGGATGTCACTTATTTATTTCAATAAATATATCGCCTAAAAACAACGCGGGGCAGGGAATGGCTGCCCCATTTAATTCTTACGCAGCGTGTGTGGt < 2:25828/300‑1 (MQ=255) aTAAATAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAATTGAGATCATAAATAATCATGCAACAGGTTATGCAAGTGCATAAATATGTGATGGATGTCACTTATTTATTTCAATAAATATATCGCCTAAAAACAACGCGGGGCAGGGAATGGCTGCCCCATTTAATTCTTACGCAGCGTGTGTGGt < 1:207207/300‑1 (MQ=255) tAAATAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAATTGAGATCATAAATAATCATGCAACAGGTTATGCAAGTGCATAAATATGTGATGGATGTCACTTATTTATTTCAATAAATATATCGCCTAAACACAACGCGGGGCAGGGAATGGCTGCCCCATTTAATTCTTACGCAGCGTGTGTGGtt > 2:362449/1‑300 (MQ=255) | AACCAAGATCATCCATGGTCAGTACGATAATATTTGGCTTTCCTTTGGTACTGTATTCTGTCGGCGTAAAGTCTGAGAAAGCAACGTTTGTTTTGGTTGCTTTCAGCTTTACATCATCTGCCGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCATTTTACTGACAAAATGCAGAATTGAGATCATAAATAATCATGCAACAGGTTATGCAAGTGCATAAATATGTGATGGATGTCACTTATTTATTTCAATAAATATATCGCCTAAAAACAACGCGGGGCAGGGAATGGCTGCCCCATTTAATTCTTACGCAGCGTGTGTGGTT > NC_000913/1582317‑1582905 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |