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Only 100 of 1423 total aligned reads displayed.
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aGTACActctggggcttcctccatgtttgctttaaaggtattggctccatggtcgccagaaagaaaatgctccattaaggcacaataactttcgctatcttcgataccccattgatcctctaaagactcgcgtcttttacttatgatatcgatcgagtcaaaaggaagcacatgatattggaaggtatctttgccaggttcaggctttcgcggccagaactccagcgtttcagaccattgcttatnatagaatcgataaggtgcgatcaattgtagcgcctgtaacttctcgatactgag < 2:522222‑M2/300‑295 (MQ=255) gTACAgcaccggaccatcatgcgccaccagcatggcctgtaatggcccatttttcactgatgccagatcgaccagaatacaatctttcggtaaaggcggtaatttgccaataacttgctcagtaacgtggattggcacactaacaatcaccattccggcatcggcaacaatatcagccgctcgatcccagncatgttgctccagaatccgcacctgataacccgagagggtcagcatcttctcgaacaggcgtcccatctgaccgccaccgccgacgataaccaccggacgcagtgacgg < 1:466476‑M2/300‑296 (MQ=255) gTACAgataggggctttcaataccgtggtaaaacaacaatggcaccaccatcggcaacgttttgtatccagcatcaaggtgattttgcattgcggcaatagcgtaacgcatcatgcgaaatgcgatcagtttgtttgaggtgctttgatgttcaatcagacaatagatgtatcctggtccttgttccgttttcaccgaccacagcacatcggaatagctttcacgcagatcgtcatcaataaagctgctcgactccagcttgagggttttcatatcacaaagcgcgtgaatgggtgccgg < 1:127294‑M2/300‑296 (MQ=255) gTACAgataggggctttcaataccgtggtaaaacaacaatggcaccaccatcggcaacgttttgtatccagcatcaaggtgattttgcattgcggcaatagcgtaacgcatcatgcgaaatgcgatcagtttgtttgaggtgctttgatgttcaatcagacaatagatgtatcctggtccttgttccgttttcaccgaccacagcacatcggaatagctttcaagcagatcgtcatcaataaagctgctcgactccagcttgagggttttcatatcacaaagcgcgtgaatgggtgccgg < 1:145322‑M2/300‑296 (MQ=255) gTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAATAAGTTTGTTTCTTCTACTTGATATAATCCTAAAAAAATCTCATAAAATTAATATATGAGATAATCTTTATTCAGCAGAAGATTATTAAAGGTTGCTGTATTATTTAGCGATAAAAAAAGCCTGCCAGATGGCAGGCTATTTAATAACGGCGTTATTATTGCAACAGCGAAATATCCGCAACGCGCAGGAACAGTTcg > 1:269203/1‑300 (MQ=255) aCAgataggtgctttcaataccgtggtaaaacaacaatggcaccaccatcggcaacgttttgtatccagcatcaaggtgattgtgcattgcggcaatagcgtaacgcatcatgcgaaatgcgatcagtttgtttgaggtgctttgatgttcaatcagacaatagatgtatcctggtccttgttccgttttcaccgaccacagcacatcggaatagctttcacgcagatcgtcatcaataaagctgctcgactccagcttgagggttttcatatcacaaagcgcgtgaatgggtgccggta > 1:63164‑M2/1‑3 (MQ=255) | TCGTATGAGAAGATATCAAAATATCCTTAAAGAACATGGTATTAAACAAAGCATGTCCAGAAAAGGCAATTGTCTGGATAATGCTGTGGTGGAGTGTTTCTTTGGAACCTTAAAGTCGGAGTGTTTTTATCTTGATGAGTTCAGTAATATAAGCGAACTGAAGGATGCTGTTACGGAATATATTGAATACTACAACAGCAGAAGAATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAAACTTTGATTTATAGTCAGGTGGGGCTTTTCTCTGTCTGCCTTTCGGTGAATACCTGAGACAAACAGTCTCAAGCACCCGTGGCTATTCTAGCTTAATAAGTTTGTTTCTTCTCCTTGATATAATCCTAAAAAAATCTCATAAAATTAATATATGAGATAATCTTTATTCAGCAGAAGATTATTAAAGGTTGCTGTATTATTTAGCGATAAAAAAAGCCTGCCAGATGGCAGGCTATTTAATAACGGCGTTATTATTGCAACAGCGAAATATCCGCAACGCGCAGGAACAGTTCGCG > NC_000913/3721776‑3722372 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |